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Enregistrement W4281618286 · doi:10.1089/forensic.2022.0007

Microbial Forensics: A Present to Future Perspective on Genomic Targets, Bioinformatic Challenges, and Applications

2022· article· en· W4281618286 sur OpenAlexaff
Rachel Shadoff, Mary Anne Panoyan, Nicole M.M. Novroski

Notice bibliographique

RevueForensic Genomics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensResearch Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeMetagenomicsHuman microbiomeHuman Microbiome ProjectComputational biologyBiologyIdentification (biology)Human healthData scienceEvolutionary biologyComputer scienceBioinformaticsGeneticsEcologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The human microbiome is a compendium of all organisms on and within the human body (i.e., bacteria, archaea, fungi, and eukaryotes), where the diversity of taxa as well as their relative abundance contribute to the highly individualizing nature of an individual's microbial signature. Discussion: The effect of individual characteristics such as lifestyle, genetics, health, and geographic provenance on the human microbiome contribute to both the individuality and forensic usefulness of microbiome samples for the purposes of human identification, body fluid attribution, estimation of the post-mortem interval, or geolocation. Further, the use of technologies such as massively parallel sequencing and long-read sequencing, in combination with bioinformatic tools and machine learning models, allow for quick and accurate characterization of individual human microbiome samples. Conclusion: However, before microbial profiling can be implemented into routine forensic casework, extensive standardization and validation of sample types, collection procedures and analysis pipelines must be established.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil0,918

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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