Language models can learn complex molecular distributions
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Deep generative models of molecules have grown immensely in popularity, trained on relevant datasets, these models are used to search through chemical space. The downstream utility of generative models for the inverse design of novel functional compounds, depends on their ability to learn a training distribution of molecules. The most simple example is a language model that takes the form of a recurrent neural network and generates molecules using a string representation. Since their initial use, subsequent work has shown that language models are very capable, in particular, recent research has demonstrated their utility in the low data regime. In this work, we investigate the capacity of simple language models to learn more complex distributions of molecules. For this purpose, we introduce several challenging generative modeling tasks by compiling larger, more complex distributions of molecules and we evaluate the ability of language models on each task. The results demonstrate that language models are powerful generative models, capable of adeptly learning complex molecular distributions. Language models can accurately generate: distributions of the highest scoring penalized LogP molecules in ZINC15, multi-modal molecular distributions as well as the largest molecules in PubChem. The results highlight the limitations of some of the most popular and recent graph generative models- many of which cannot scale to these molecular distributions.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle