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Enregistrement W4281625021 · doi:10.1126/science.abn6358

Diversity and ecological footprint of Global Ocean RNA viruses

2022· article· en· W4281625021 sur OpenAlexaff
Guillermo Domínguez‐Huerta, Ahmed A. Zayed, James M. Wainaina, Jiarong Guo, Funing Tian, Akbar Adjie Pratama, Benjamin Bolduc, Mohamed Mohssen, Olivier Zablocki, Éric Pelletier, Erwan Delage, Adriana Alberti, Jean‐Marc Aury, Quentin Carradec, Corinne Da Silva, Karine Labadie, Julie Poulain, Chris Bowler, Damien Eveillard, Lionel Guidi, Eric Karsenti, Jens H. Kuhn, Hiroyuki Ogata, Patrick Wincker, Alexander I. Culley, Samuel Chaffron, Matthew B. Sullivan

Notice bibliographique

RevueScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesRégion BretagneGrand Équipement National De Calcul IntensifEuropean Molecular Biology LaboratoryKing Abdullah University of Science and TechnologyCentre National de la Recherche ScientifiqueNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesOhio State UniversitySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungGordon and Betty Moore FoundationAgence Nationale de la RechercheNational Aeronautics and Space AdministrationNational Science Foundation
Mots-clésBiologyEcologyRNABiogeochemical cycleEcosystemPlanktonRNA virusViral evolutionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA viruses are increasingly recognized as influencing marine microbes and microbe-mediated biogeochemical cycling. However, little is known about global marine RNA virus diversity, ecology, and ecosystem roles. In this study, we uncover patterns and predictors of marine RNA virus community- and "species"-level diversity and contextualize their ecological impacts from pole to pole. Our analyses revealed four ecological zones, latitudinal and depth diversity patterns, and environmental correlates for RNA viruses. Our findings only partially parallel those of cosampled plankton and show unexpectedly high polar ecological interactions. The influence of RNA viruses on ecosystems appears to be large, as predicted hosts are ecologically important. Moreover, the occurrence of auxiliary metabolic genes indicates that RNA viruses cause reprogramming of diverse host metabolisms, including photosynthesis and carbon cycling, and that RNA virus abundances predict ocean carbon export.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,506
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,006
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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