Épidémiologie de la méningococcie invasive au Canada, 2012 à 2019
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : Divers programmes de vaccination contre le méningocoque chez les enfants et les adolescents utilisant des vaccins conjugués monovalents (sérogroupe C) et quadrivalents (A, C, Y, W) ont été mis en œuvre au Canada depuis 2002, ce qui a entraîné une diminution de la méningococcie invasive (MI), en particulier chez le sérogroupe C. Les vaccins contre le méningocoque ont également été utilisés pour la lutte contre l’éclosion, notamment le à plusieurs composants contre le sérogroupe B. Le présent article décrit l’épidémiologie de la MI au Canada de 2012 à 2019. Méthodes : Les données sur les cas ont été obtenues du Système national de surveillance améliorée de la méningococcie invasive entre le 1er janvier 2012 et le 31 décembre 2019. Les isolats ont été envoyés au Laboratoire national de microbiologie pour la confirmation du sérogroupe et d’autres études, y compris l’identification du phénotype et du complexe clonal. Résultats : Au total, 983 cas de MI ont été signalés entre 2012 et 2019. Dans l’ensemble, l’incidence de la MI ajustée selon l’âge de 2012 à 2019 était de 0,34 cas par 100 000 habitants par année lorsqu’elle était normalisée à la répartition selon l’âge de la population canadienne de 2011 (IC à 95 % : 0,32 à 0,36). Les nourrissons de moins d’un an présentaient le taux d’incidence moyen le plus élevé selon l’âge (3,6 cas pour 100 000 habitants par année, IC à 95 % : 2,8 à 4,3). Le taux d’incidence ajusté selon l’âge le plus élevé a été associé au sérogroupe B (0,17 cas pour 100 000 habitants par année, IC à 95 % : 0,16-0,19). Avant 2015, la plupart des isolats de sérogroupe W invasif ont été identifiés comme étant le complexe clonal 22 (ST-22 CC) et l’augmentation du sérogroupe W au Canada au cours des dernières années a été associée au remplacement du ST-22 CC endémique par le ST-11 CC hypervirulent. Conclusion : La méningococcie invasive est une infection rare, mais grave au Canada qui touche surtout les très jeunes enfants. Le sérogroupe B continue de représenter la plus grande proportion de la maladie. Le sérogroupe W associé au virus ST-11 CC devient un contributeur croissant de maladies dans tous les groupes d’âge non protégés par les vaccins contenant le sérogroupe W.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».