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Enregistrement W4281649836 · doi:10.1101/2022.05.29.493876

Prominent astrocytic alpha-synuclein pathology with unique post-translational modification signatures unveiled across Lewy body disorders

2022· preprint· en· W4281649836 sur OpenAlexfundno aff
Melek Firat Altay, Alan King Lun Liu, Janice L. Holton, Laura Parkkinen, Hilal A. Lashuel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilReta Lila Weston Institute of Neurological Studies, UCL Queen Square Institute of Neurology,University College LondonSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Institute for Health and Care ResearchAlzheimer SocietyÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchNational Science Foundation
Mots-clésLewy bodyAlpha-synucleinDementia with Lewy bodiesSynucleinopathiesPathologyNeuroscienceDementiaSynucleinBiologyParkinson's diseaseMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Alpha-synuclein (aSyn) is a pre-synaptic monomeric protein that can form aggregates in neurons in Parkinson’s disease (PD), Parkinson’s disease with dementia (PDD) and dementia with Lewy bodies (DLB), and in oligodendrocytes in multiple system atrophy (MSA). Although the accumulation of aSyn in astrocytes has previously been described in PD, PDD and DLB, the biochemical properties of aSyn in this type of pathology and its topographical distribution have not been studied in detail. Here, we present a systematic investigation of aSyn astrocytic pathology, using an expanded toolset of antibodies covering the entire sequence and known post-translational modifications (PTMs) of aSyn in Lewy body (LB) disorders, including sporadic PD, PDD, DLB, familial PD with SNCA G51D mutation and SNCA duplication, and in MSA. Astrocytic aSyn was mainly detected in the limbic cortical regions of LB disorders, but were absent in key pathological regions of MSA. These astrocytic aSyn accumulations were detected only with aSyn antibodies against the mid N-terminal and non-amyloid component (NAC) regions covering aSyn residues 34-99. The astroglial accumulations were negative to canonical aSyn aggregation markers, including p62, ubiquitin and aSyn pS129, but positive for phosphorylated and nitrated forms of aSyn at Tyrosine 39 (Y39), and mostly not resistant to proteinase K. Our findings suggest that astrocytic aSyn accumulations are a major part of aSyn pathology in LB disorders, and possess a distinct sequence and PTM signature that is characterized by both N- and C-terminal truncations and modifications at Y39. To the best of our knowledge, this is the first description of aSyn accumulation made solely from N- and C-terminally cleaved aSyn species and the first report demonstrating that astrocytic aSyn exists as a mixture of Y39 phosphorylated and nitrated species. These observations underscore the critical importance of systematic characterization of aSyn accumulation in different cell types as a necessary step to capturing the diversity of aSyn species and pathology in the brain. Our findings combined with further studies on the role of astrocytic pathology in the progression of LB disorders can pave the way towards identifying novel disease mechanisms and therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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