1396-P: Critical Cellular Functions That Mediate the Early Stages of Adipogenesis Are Directly Influenced by 14-3-3zeta and Its Interactome
Notice bibliographique
Résumé
Aim: We previously discovered that 14-3-3-zeta (14-3-3ζ) was essential for adipocyte differentiation. Although 14-3-3ζ scaffold is not a transcription factor (TF) , it undergoes nuclear translocation during adipogenesis. Considering its diverse interactome, we hypothesized that 14-3-3ζ anchors, nucleates and regulates essential transcriptional complexes required for adipogenesis. Methods: 3T3-L1 pre-adipocytes were modified by CRISPR-Cas9 to express a TAP (Flag-HA) -tagged 14-3-3ζ protein. At 48 first hours of adipogenesis, nuclear TAP-14-3-3-ζ complexes were purified to identify and annotate the 14-3-3ζ interactome by MS and Gene Ontology. Highly enriched proteins functions were assessed for their roles in adipogenesis using pharmacological inhibitors or siRNA. In parallel, chromatin accessibility was assessed by ATAC-Seq from control or 14-3-3ζ-depleted 3T3-L1 cells during early adipogenesis. Results: We found that the 14-3-3ζ nuclear interactome during the early stages of adipogenesis was significantly enriched with 133 proteins, including CEBP-β, an early adipogenic TF. According to GO analysis, proteins within the 14-3-3ζ interactome were primarily associated (FDR ≤ 0.01) with histone H2B ubiquitination, DNA unwinding for replication, DNA hypermethylation and ribosome assembly. Pharmacological inhibition or depletion by siRNA of these proteins significantly dampened adipocyte differentiation. Principal component analysis of ATAC-seq results revealed that samples from 14-3-3ζ-depleted cells differed from controls in term of whole chromatin accessibility, and DESeq2 identified nearly 3400 (p<0.05) differentially accessible regions of open chromatin following 14-3-3ζ depletion. Conclusion: These results reveal that via critical protein interactions, 14-3-3ζ has essential roles in chromatin accessibility, DNA replication, and mRNA translation, which are crucial events for the early adipogenesis. Disclosure S.A.Rial: None. A.Alkhoury: None. G.Lavoie: None. P.Roux: None. T.M.Durcan: None. A.Martinez-sanchez: None. G.E.Lim: None. Funding Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) ; Canada Research Chairs (CRC) ; Fonds de recherche du Québec-Nature and Technologies (FRQNT)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».