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Enregistrement W4281672016 · doi:10.1186/s13195-022-01021-8

Quantification of SNAP-25 with mass spectrometry and Simoa: a method comparison in Alzheimer’s disease

2022· article· en· W4281672016 sur OpenAlexafffund
Johanna Nilsson, Nicholas J. Ashton, Andréa Lessa Benedet, Laia Montoliu‐Gaya, Johan Gobom, Tharick A. Pascoal, Mira Chamoun, Erik Portelius, Andreas Jeromin, Muriel Mendes, Henrik Zetterberg, Pedro Rosa‐Neto, Ann Brinkmalm, Kaj Blennow

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s Research & Therapy · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalMontreal Neurological Institute and HospitalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchGöteborgs Universitet
Mots-clésSnapMedicineCerebrospinal fluidNeurologyPathologyInternal medicinePathophysiologyCohortBiomarkerChemistryPsychiatryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Synaptic dysfunction and degeneration are central to Alzheimer's disease (AD) and have been found to correlate strongly with cognitive decline. Thus, studying cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers reflecting synaptic degeneration, such as the presynaptic protein synaptosomal-associated protein 25 (SNAP-25), is of importance to better understand the AD pathophysiology. METHODS: We compared a newly developed Single molecule array (Simoa) immunoassay for SNAP-25 with an in-house immunoprecipitation mass spectrometry (IP-MS) method in a well-characterized clinical cohort (n = 70) consisting of cognitively unimpaired (CU) and cognitively impaired (CI) individuals with and without Aβ pathology (Aβ+ and Aβ-). RESULTS: ) > 0.88; p < 0.0001) was found between the Simoa and IP-MS methods, and no statistically significant difference was found for their clinical performance to identify AD pathophysiology in the form of Aβ pathology. Increased CSF SNAP-25 levels in CI Aβ+ compared with CU Aβ- (Simoa, p ≤ 0.01; IP-MS, p ≤ 0.05) and CI Aβ- (Simoa, p ≤ 0.01; IP-MS, p ≤ 0.05) were observed. In independent blood samples (n = 32), the Simoa SNAP-25 assay was found to lack analytical sensitivity for quantification of SNAP-25 in plasma. CONCLUSIONS: These results indicate that the Simoa SNAP-25 method can be used interchangeably with the IP-MS method for the quantification of SNAP-25 in CSF. Additionally, these results confirm that CSF SNAP-25 is increased in relation to amyloid pathology in the AD continuum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,392
Score d'incertitude au seuil0,956

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,447
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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