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Enregistrement W4281672300 · doi:10.21203/rs.3.rs-1695738/v1

Robust Formation of Optimal Single Spheroids towards Cost-Effective In-Vitro 3-Dimensional Tumor Models

2022· preprint· en· W4281672300 sur OpenAlexfundno aff
Kinana Habra, Joshua R. D. Pearson, Stéphanie McArdle

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpaceflight effects on biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTrent UniversityNottingham Trent University
Mots-clésSpheroidConfocal microscopyIn vivoCancer cellCell cultureCell biologyIn vitroCellBiologyCancerChemistryBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Monolayer cell cultures, while useful for basic in vitro studies, are not physiologically relevant. Spheroids, a complex 3-dimensional (3D) structure resemble in vivo tumor growth more closely thereby allowing results obtained with spheroids relating to proliferation, cell death, differentiation, metabolism, and various anti-tumor therapies to be more predictive of in vivo outcomes. The protocol herein presents a rapid and high throughput method for the generation of single spheroids using various cancer cell lines including (U87 MG, SEBTA-027, SF188) brain cancer cells, (DU-145, TRAMP-C1) prostate cancer cells, and (BT-549, Py230) breast cancer cells in a 96-round bottom well plates. The proposed method is associated with significantly low costs (ca. £1) per plate without the need for refining or transferring and homogeneous compact spheroid morphology was evidenced as early as 1 day after following this protocol. By using confocal microscopy and the IncuCyte live imaging system, proliferating cells were traced in the rim while dead cells were found to be located inside the core region of the spheroid. H&E staining of spheroid sections was utilized to investigate the tightness of the cell packaging and Western blotting analyses revealed that these spheroids adopted a stem cell-like phenotype. This method was also used to obtain EC50 of the anti-cancer dipeptide carnosine on U87 MG 3D culture. The affordable easy-to-follow 5 step-protocol allows for robust generation of various uniform spheroids which show 3D morphology characteristics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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