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Enregistrement W4281684920 · doi:10.1093/molehr/gaac022

Cannabis significantly alters DNA methylation of the human ovarian follicle in a concentration-dependent manner

2022· article· en· W4281684920 sur OpenAlex
Noga Fuchs Weizman, Brandon A. Wyse, Janice Montbriand, Sahar Jahangiri, Clifford Librach

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Human Reproduction · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreHealth Sciences CentreCReATe Fertility Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDNA methylationEpigeneticsDifferentially methylated regionsMethylationHistoneGeneticsEpigenomicsCannabisMethyltransferaseGeneGene expressionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cannabis is increasingly consumed by women of childbearing age, and the reproductive and epigenetic effects are unknown. The purpose of this study was to evaluate the potential epigenetic implications of cannabis use on the female ovarian follicle. Whole-genome methylation was assessed in granulosa cells from 14 matched case-control patients. Exposure status was determined by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) measurements of five cannabis-derived phytocannabinoids in follicular fluid. DNA methylation was measured using the Illumina TruSeq Methyl Capture EPIC kit. Differential methylation, pathway analysis and correlation analysis were performed. We identified 3679 differentially methylated sites, with two-thirds affecting coding genes. A hotspot region on chromosome 9 was associated with two genomic features, a zinc-finger protein (ZFP37) and a long non-coding RNA (FAM225B). There were 2214 differentially methylated genomic features, 19 of which have been previously implicated in cannabis-related epigenetic modifications in other organ systems. Pathway analysis revealed enrichment in G protein-coupled receptor signaling, cellular transport, immune response and proliferation. Applying strict criteria, we identified 71 differentially methylated regions, none of which were previously annotated in this context. Finally, correlation analysis revealed 16 unique genomic features affected by cannabis use in a concentration-dependent manner. Of these, the histone methyltransferases SMYD3 and ZFP37 were hypomethylated, possibly implicating histone modifications as well. Herein, we provide the first DNA methylation profile of human granulosa cells exposed to cannabis. With cannabis increasingly legalized worldwide, further investigation into the heritability and functional consequences of these effects is critical for clinical consultation and for legalization guidelines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle