Polycomb repressive complex 2 shields naïve human pluripotent cells from trophectoderm differentiation
Notice bibliographique
Résumé
The first lineage choice in human embryo development separates trophectoderm from the inner cell mass. Naïve human embryonic stem cells are derived from the inner cell mass and offer possibilities to explore how lineage integrity is maintained. Here, we discover that polycomb repressive complex 2 (PRC2) maintains naïve pluripotency and restricts differentiation to trophectoderm and mesoderm lineages. Through quantitative epigenome profiling, we found that a broad gain of histone H3 lysine 27 trimethylation (H3K27me3) is a distinct feature of naïve pluripotency. We define shared and naïve-specific bivalent promoters featuring PRC2-mediated H3K27me3 concomitant with H3K4me3. Naïve bivalency maintains key trophectoderm and mesoderm transcription factors in a transcriptionally poised state. Inhibition of PRC2 forces naïve human embryonic stem cells into an 'activated' state, characterized by co-expression of pluripotency and lineage-specific transcription factors, followed by differentiation into either trophectoderm or mesoderm lineages. In summary, PRC2-mediated repression provides a highly adaptive mechanism to restrict lineage potential during early human development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».