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Enregistrement W4281693716 · doi:10.1371/journal.pone.0269342

Investigating CRISPR/Cas9 gene drive for production of disease-preventing prion gene alleles

2022· article· en· W4281693716 sur OpenAlexafffund
Andrew R. Castle, Serene Wohlgemuth, Luis Arce, David Westaway

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaAlberta Prion Research InstituteDirectorate for Biological SciencesCanada Foundation for InnovationUniversity of Alberta
Mots-clésPRNPBiologyCRISPRGeneticsGeneOpen reading frameCas9PopulationGene driveVirologyAllelePeptide sequenceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prion diseases are a group of fatal neurodegenerative disorders that includes chronic wasting disease, which affects cervids and is highly transmissible. Given that chronic wasting disease prevalence exceeds 30% in some endemic areas of North America, and that eventual transmission to other mammalian species, potentially including humans, cannot be ruled out, novel control strategies beyond population management via hunting and/or culling must be investigated. Prion diseases depend upon post-translational conversion of the cellular prion protein, encoded by the Prnp gene, into a disease-associated conformation; ablation of cellular prion protein expression, which is generally well-tolerated, eliminates prion disease susceptibility entirely. Inspired by demonstrations of gene drive in caged mosquito species, we aimed to test whether a CRISPR/Cas9-based gene drive mechanism could, in principle, promote the spread of a null Prnp allele among mammalian populations. First, we showed that transient co-expression of Cas9 and Prnp-directed guide RNAs in RK13 cells generates indels within the Prnp open-reading frame, indicating that repair of Cas9-induced double-strand breaks by non-homologous end-joining had taken place. Second, we integrated a ~1.2 kb donor DNA sequence into the Prnp open-reading frame in N2a cells by homology-directed repair following Cas9-induced cleavages and confirmed that integration occurred precisely in most cases. Third, we demonstrated that electroporation of Cas9/guide RNA ribonucleoprotein complexes into fertilised mouse oocytes resulted in pups with a variety of disruptions to the Prnp open reading frame, with a new coisogenic line of Prnp-null mice obtained as part of this work. However, a technical challenge in obtaining expression of Cas9 in the male germline prevented implementation of a complete gene drive mechanism in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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