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Enregistrement W4281695630 · doi:10.1038/s41467-022-30913-4

Expansion of cytotoxic tissue-resident CD8+ T cells and CCR6+CD161+ CD4+ T cells in the nasal mucosa following mRNA COVID-19 vaccination

2022· article· en· W4281695630 sur OpenAlexafffund
Aloysious Ssemaganda, Huong Mai Nguyen, Faisal Nuhu, Naima Jahan, Catherine M. Card, Sandra Kiazyk, Giulia Severini, Yoav Keynan, Ruey‐Chyi Su, Hezhao Ji, Bernard Abrenica, Paul J. McLaren, T. Blake Ball, Jared Bullard, Paul Van Caeseele, Derek R. Stein, Lyle R. McKinnon

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCD8Cytotoxic T cellVaccinationImmunologyFlow cytometryImmune systemC-C chemokine receptor type 6CD3MedicineBiologyIn vitroChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Vaccines against SARS-CoV-2 have shown high efficacy in clinical trials, yet a full immunologic characterization of these vaccines, particularly within the human upper respiratory tract, is less well known. Here, we enumerate and phenotype T cells in nasal mucosa and blood using flow cytometry before and after vaccination with the Pfizer-BioNTech COVID-19 vaccine ( n = 21). Tissue-resident memory (Trm) CD8 + T cells expressing CD69 + CD103 + increase in number ~12 days following the first and second doses, by 0.31 and 0.43 log 10 cells per swab respectively ( p = 0.058 and p = 0.009 in adjusted linear mixed models). CD69 + CD103 + CD8 + T cells in the blood decrease post-vaccination. Similar increases in nasal CD8 + CD69 + CD103 − T cells are observed, particularly following the second dose. CD4 + cells co-expressing CCR6 and CD161 are also increased in abundance following both doses. Stimulation of nasal CD8 + T cells with SARS-CoV-2 spike peptides elevates expression of CD107a at 2- and 6-months ( p = 0.0096) post second vaccine dose, with a subset of donors also expressing increased cytokines. These data suggest that nasal T cells may be induced and contribute to the protective immunity afforded by this vaccine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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