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Enregistrement W4281698725 · doi:10.1101/2022.05.29.493904

Two-Stage Multivariate Mendelian Randomization on Multiple Outcomes with Mixed Distributions

2022· preprint· en· W4281698725 sur OpenAlexafffund
Yangqing Deng, Dongsheng Tu, Chris J. O’Callaghan, Geoffrey Liu, Wei Xu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreQueen's UniversityUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPrincess Margaret Cancer Foundation
Mots-clésMendelian randomizationMultivariate statisticsConfoundingUnivariateCausal inferenceInstrumental variableMultivariate analysisRandomizationRandomized controlled trialStatisticsOutcome (game theory)EconometricsInferenceComputer scienceMedicineMathematicsArtificial intelligenceInternal medicineGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

S ummary In clinical research, it is of importance to study whether certain clinical factors or exposures have causal effects on clinical and patient reported outcomes like toxicities, quality of life, and self-reported symptoms, which can help improve patient care. Usually, such outcomes are recorded as multiple variables with different distributions. Mendelian randomization is a commonly used technique for causal inference with the help of genetic instrumental variables to deal with observed and unobserved confounders. Nevertheless, the current methodology of Mendelian randomization on multiple outcomes only focuses on one outcome at a time, meaning that it does not consider the correlation structure of multiple outcomes, which may lead to loss of statistical power. In situations with multiple outcomes of interest, especially when there are mixed correlated outcomes with multiple distributions, it is much more desirable to jointly analyze them with a multivariate approach. Some multivariate methods have been proposed to model mixed outcomes, however, they do not incorporate instrumental variables and cannot handle unmeasured confounders. To overcome the above challenges, we propose a two-stage multivariate Mendelian Randomization Method (MRMO), that can perform multivariate analysis on mixed outcomes using instrumental variables. We demonstrate that our proposed MRMO algorithm can gain power over the existing univariate method through simulation studies and a clinical application on a randomized Phase III clinical trial study on colorectal cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,072
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,208

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,072
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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