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Enregistrement W4281703136 · doi:10.3390/jof8060585

Concurrent Infection with SARS-CoV-2 and Pneumocystis jirovecii in Immunocompromised and Immunocompetent Individuals

2022· review· en· W4281703136 sur OpenAlexaff
Hanan Albasata, Seyed M. Hosseini‐Moghaddam

Notice bibliographique

RevueJournal of Fungi · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumocystis jirovecii pneumonia detection and treatment
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPneumocystis jiroveciiVirologyBiologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Pneumocystis cariniiPneumocystosisPneumoniaImmunologyMicrobiologyMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Human immunodeficiency virus (HIV)Infectious disease (medical specialty)Disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coronavirus disease 2019 (COVID-19) may occur with concurrent infections caused by bacterial and fungal microorganisms. This systematic review evaluated studies reporting concomitant COVID-19 and Pneumocystis jirovecii pneumonia (PJP). We found 39 patients (74% male, median age: 56.8 (range: 11–83) years), including 66% immunosuppressed individuals (23% HIV-infected and 41% on long-term corticosteroid therapy). Patients were characteristically severely ill (mechanical ventilation: 70%), associated with 41% mortality. The median lymphocyte count was 527 cells/mm3 (range: 110–2200), and the median CD4+ T cell count was 206 cells/mm3 (range: 8–1021). We identified three patterns of concurrent COVID-19 and P. jirovecii infection. The first pattern (airway colonization with a low burden of P. jirovecii) does not seem to modify the COVID-19 course of illness. However, P. jirovecii superinfection, typically occurring weeks after COVID-19 diagnosis as a biphasic illness, and P. jirovecii coinfection characteristically results in progressive multilobar pneumonia, which is associated with poor outcomes. To support this categorization, we reported three patients with concurrent PJP and COVID-19 identified in our institution, presenting these clinical scenarios. The diagnosis of PJP requires a high index of suspicion, since clinical and radiological characteristics overlap with COVID-19. Observational studies are necessary to determine the PJP burden in patients with COVID-19 requiring hospitalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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