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Enregistrement W4281708551 · doi:10.1101/2022.06.06.494859

Amygdalar and ERC Rostral Atrophy and Tau Pathology Reconstruction in Preclinical Alzheimer’s Disease

2022· preprint· en· W4281708551 sur OpenAlexfundno aff
Kaitlin Stouffer, Claire Chen, Sue Kulason, Eileen Xu, Menno P. Witter, Can Ceritoglu, Marilyn Albert, Susumu Mori, Juan C. Troncoso, Daniel J. Tward, Michael I. Miller

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNational Institutes of HealthKaren Toffler Charitable TrustNorthern California Institute for Research and EducationNovartis Pharmaceuticals CorporationBioClinicaU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeUniversity of Southern CaliforniaBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésEntorhinal cortexAtrophyTemporal lobeAmygdalaNeuroscienceAlzheimer's diseasePathologyNeuroimagingDementiaHippocampusPsychologyTau pathologyMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Previous research has emphasized the unique impact of Alzheimer’s Disease (AD) pathology on the medial temporal lobe (MTL), a reflection that tau pathology is particularly striking in the entorhinal and transentorhinal cortex (ERC, TEC) early in the course of disease. However, other brain regions are affected by AD pathology during its early phases. Here, we use longitudinal diffeomorphometry to measure the atrophy rate from MRI of the amygdala compared with that in the ERC and TEC in controls, individuals who progressed from normal cognition to mild cognitive impairment (MCI), and individuals with MCI who progressed to AD dementia, using a dataset from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). Our results show significantly higher atrophy rates of the amygdala in both preclinical and MCI ‘converters’ compared to controls, with rates of volume loss comparable to rates of thickness loss in the ERC and TEC. Using our recently developed method, referred to as Projective LDDMM, we map measures of neurofibrillary tau tangles (NFTs) from digital pathology to MRI atlases and reconstruct, for the first time, dense 3D spatial distributions of NFT density within regions of the MTL. The distribution of NFTs is consistent with the MR atrophy rates, revealing high densities not only in ERC, but in the amygdala and rostral third of the MTL. The similarity of the location of NFTs and shape changes in a well-defined clinical population suggests that amygdalar atrophy rate, as measured through MRI may be a viable biomarker for AD. PACS 0000, 1111 2000 MSC 0000, 1111 Highlights Amygdala atrophy rate estimated from MRIs in preclinical Alzheimer’s disease (AD) 3D distributions of neurofibrillary tau tangles (NFTs) reconstructed from 2D histology NFTs highest in the rostral medial temporal lobe, including amygdala and ERC Amygdala atrophy rate is comparable to ERC atrophy rate in preclinical AD Amygdala and ERC atrophy rates as potential biomarkers rooted in NFT pathology

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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