<i>N</i> -hydroxy pipecolic acid methyl ester is involved in Arabidopsis immunity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The biosynthesis of N -hydroxy pipecolic acid (NHP) has been intensively studied, though knowledge on its metabolic turnover is still scarce. To close this gap, we discovered three novel metabolites via metabolite fingerprinting in Arabidopsis thaliana leaves. Exact mass information and fragmentation by mass spectrometry (MSMS) suggest a methylated derivative of NHP (MeNHP), a NHP- O Glc-hexosyl conjugate (NHP- O Glc-Hex) and an additional NHP- O Glc-derivative. All three compounds were formed in wildtype leaves but not present in the NHP deficient mutant fmo1-1 . The identification of these novel NHP-based molecules was possible by a dual-infiltration experiment using a mixture of authentic NHP- and D 9 -NHP-standards for leaf infiltration followed by an UV-C treatment. Interestingly, the signal intensity of MeNHP and other NHP-derived metabolites increased in ugt76b1-1 mutant plants. This suggests a detour, for the inability to synthesize NHP- O -glucoside. For MeNHP, we unequivocally determined the site of methylation at the carboxylic acid function. MeNHP application by leaf infiltration leads to the detection of a MeNHP- O Glc as well as NHP, suggesting MeNHP-hydrolysis to NHP. This is in line with the observation that MeNHP-infiltration is able to rescue the fmo1-1 susceptible phenotype against Hyaloperonospora arabidopsidis Noco 2. Together these data suggest MeNHP as additional storage or transport form of NHP. Highlight In this work, we identify N -hydroxy pipecolic acid (NHP) metabolites including methyl ester and complex glycosides. The application of methyl ester is able to rescue the disease phenotype of the biosynthesis deficient mutant of NHP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».