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Enregistrement W4281719675 · doi:10.3389/fimmu.2022.863234

Immunoinformatic Design of a Multivalent Peptide Vaccine Against Mucormycosis: Targeting FTR1 Protein of Major Causative Fungi

2022· article· en· W4281719675 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMucormycosisMicrobiologyPeptide vaccinePeptideBiologyMedicineVirologyImmunologyBiochemistryAntibodyEpitopePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mucormycosis is a potentially fatal illness that arises in immunocompromised people due to diabetic ketoacidosis, neutropenia, organ transplantation, and elevated serum levels of accessible iron. The sudden spread of mucormycosis in COVID-19 patients engendered massive concern worldwide. Comorbidities including diabetes, cancer, steroid-based medications, long-term ventilation, and increased ferritin serum concentration in COVID-19 patients trigger favorable fungi growth that in turn effectuate mucormycosis. The necessity of FTR1 gene-encoded ferrous permease for host iron acquisition by fungi has been found in different studies recently. Thus, targeting the transit component could be a potential solution. Unfortunately, no appropriate antifungal vaccine has been constructed as of yet. To date, mucormycosis has been treated with antiviral therapy and surgical treatment only. Thus, in this study, the FTR1 protein has been targeted to design a convenient and novel epitope-based vaccine with the help of immunoinformatics against four different virulent fungal species. Furthermore, the vaccine was constructed using 8 CTL, 2 HTL, and 1 LBL epitopes that were found to be highly antigenic, non-allergenic, non-toxic, and fully conserved among the fungi under consideration. The vaccine has very reassuring stability due to its high pI value of 9.97, conclusive of a basic range. The vaccine was then subjected to molecular docking, molecular dynamics, and immune simulation studies to confirm the biological environment’s safety, efficacy, and stability. The vaccine constructs were found to be safe in addition to being effective. Finally, we used in-silico cloning to develop an effective strategy for vaccine mass production. The designed vaccine will be a potential therapeutic not only to control mucormycosis in COVID-19 patients but also be effective in general mucormycosis events. However, further in vitro , and in vivo testing is needed to confirm the vaccine’s safety and efficacy in controlling fungal infections. If successful, this vaccine could provide a low-cost and effective method of preventing the spread of mucormycosis worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle