Metabolomic Biomarkers to Predict and Diagnose Cystic Fibrosis Pulmonary Exacerbations: A Systematic Review
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Metabolomics is an emerging area of research and has the potential to identify clinical biomarkers for predicting or diagnosing cystic fibrosis (CF) pulmonary exacerbations (PEx). Objective: To identify clinically promising metabolites across different sample sources that can be used to predict or diagnose PEx in CF. Evidence Review: Searches for original literature were completed through EMBASE, MEDLINE, and all databases on the Web of Science with no restrictions on language or publication date. Gray literature was collected through Google Scholar. Additional studies were obtained by contacting authors and searching reference lists of candidate papers. The patient population included individuals with CF. Studies involving patients who underwent lung transplantation were excluded. The outcome was the prediction or diagnosis of pulmonary exacerbations from metabolites directly measured from biological samples. Search results were downloaded and imported into Covidence and duplicates were removed automatically. Any remaining duplicates were manually tagged and excluded. Two independent reviewers screened each abstract for eligibility and repeated this process for full texts. Risk of bias was conducted using QUADAS-2 by two independent reviewers. A third author resolved any remaining conflicts. Results: A combined 3974 relevant abstracts were identified and 115 full texts were assessed for eligibility. The final 25 studies underwent data extraction for study design, patient demographics, studied metabolites, concentration values, and diagnostic accuracy values. Included studies differed considerably in methodologies, sample specimen types (exhaled breath condensate [EBC], sputum, saliva, plasma, urine), and disease states. We identified 19 unique metabolites that were measured by two or more studies of which 2 have the potential to predict PEx (EBC 4-hydroxycyclohexylcarboxylic acid [4-HCHC] and lactic acid) and 6 to diagnose PEx (EBC 4-HCHC and lactic acid, sputum lactic acid and nitrate, and plasma arginine and methionine). Conclusion and Relevance: https://www.crd.york.ac.uk/prospero/.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».