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Enregistrement W4281738891 · doi:10.1101/2022.06.08.495344

Alterations in neural stem cell quiescence and activation in the 3xTG-AD model of Alzheimer’s Disease

2022· preprint· en· W4281738891 sur OpenAlexaff
Yubing Liu, Bensun C. Fong, Richard A. Harris, Marie-Michelle McNicoll, Amaal A. Abdi, Jacob B. Cuthbert, David P. Cook, Daniel Figeys, Jing Wang, Barbara C. Vanderhyden, Ruth S. Slack

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensOttawa HospitalHeart and Stroke FoundationUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurogenesisNeural stem cellNeuroscienceBiologyCognitive declineProgenitor cellSubgranular zonePopulationDementiaStem cellCell biologyDiseaseMedicinePathologySubventricular zone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Alzheimer’s Disease (AD) is the most common form of dementia with progressive cognitive deficits and mood disorders (Knopman et al., 2021). Recent studies have associated AD pathology with the impairment of adult neurogenesis, as indicated by impaired neural stem cell (NSCs) homeostasis (Bond et al., 2015). Recent work has further associated AD progression with a decline in the number and maturation of adult-born neurons in the SGZ, distinct from typical age-related decline (Moreno-Jiménez et al., 2019). In 3xTG-AD mice, a well-established mouse model of AD, our and other groups have demonstrated impairments to NSC pool and neural progenitor proliferation, as well as adult-born neurons, before the onset of Aβ plaques and NFTs (Hamilton et al., 2010, 2015; Rodríguez et al., 2008, 2009). However, the regulatory mechanisms underlying the functional impairment of adult NSCs remain to be resolved. Here, we employ single-cell RNA-Seq to establish population-specific defects in the 3xTG-AD mouse model during adult SGZ neurogenesis. Relative to control mice, we observe a dramatic AD-induced decrease in the primed and activated NSC population, which results in a progressive loss of cells committed to neurogenesis. Transcriptome measurements suggest that 3xTG-AD NSCs and their progeny represent enhanced ribosomal and mitochondrial biogenesis, and disturbed Notch signaling pathway. RNA velocity analysis reveals reduced NSC activation as evidenced by a large fraction of Ascl1-postive cells, instead of entering cell cycle, returning to the primed and quiescent state. This is further supported by reduced numbers of Lpar1-expressing cells, a marker of neural progenitor cells, in the SGZ. Our work explores, at a stage-specific resolution, changes in the regulatory networks guiding adult neurogenesis, and identifies niche disturbances in the regulation of NSC quiescence and activation. These NSC deficits underlying impaired neurogenesis identified in AD mice, may be key contributors underlying the compromised hippocampal function in AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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