MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4281744037 · doi:10.1101/2022.06.06.494935

Molecular insights into intrinsic transducer-coupling bias in the CXCR4-CXCR7 system

2022· preprint· en· W4281744037 sur OpenAlexaff
Parishmita Sarma, Hyejin Yoon, Carlo Marion C. Carino, S. Deeksha, Ramanuj Banerjee, Yaejin Yun, Jeongsek Ji, Kyung-Jin Min, Shubhi Pandey, Hemlata Dwivedi‐Agnihotri, Rui Xue, Yubo Cao, Kouki Kawakami, Poonam Kumari, Yu‐Chih Chen, Kathryn E. Luker, Manish K. Yadav, Ashutosh Ranjan, Madhu Chaturvedi, Jagannath Maharana, Mithu Baidya, Prem N. Yadav, Gary D. Luker, Stéphane A. Laporte, Xin Chen, Asuka Inoue, Hyung Ho Lee, Arun K. Shukla

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesSamsungScience and Engineering Research BoardThe Wellcome Trust DBT India AllianceIndian Council of Medical ResearchCouncil of Scientific and Industrial Research, IndiaDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaIndian Institute of Technology KanpurWellcome Trust
Mots-clésG protein-coupled receptorChemokine receptorG protein-coupled receptor kinaseArrestinReceptorCell biologyAgonistFunctional selectivityBiologyChemokineSignal transductionChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chemokine receptors constitute an important subfamily of G protein-coupled receptors (GPCRs), and they are critically involved in a broad range of immune response mechanisms. Ligand promiscuity among these receptors makes them an interesting target to explore novel aspects of biased agonism. Here, we comprehensively characterize two chemokine receptors namely, CXCR4 and CXCR7, which share a common chemokine agonist (CXCL12), in terms of their G-protein coupling, β-arrestin (βarr) recruitment, contribution of GRKs, and ERK1/2 MAP kinase activation. We observe that CXCR7 lacks G-protein coupling while maintaining robust βarr recruitment with a major contribution of GRK5/6. On the other hand, CXCR4 displays robust G-protein activation as expected, however, it exhibits significantly reduced βarr-coupling compared to CXCR7 in response to their shared natural agonist, CXCL12. These two receptors induce distinct βarr conformations even when activated by the same agonist, and CXCR7, unlike CXCR4, fails to activate ERK1/2 MAP kinase. We further determine the crystal structure of βarr2 in complex with a carboxyl-terminal phosphopeptide derived from CXCR7, which reveals a smaller interdomain rotation than observed previously for activated βarrs. Importantly, structure-guided cellular experiments reveal a key contribution of a single phosphorylation site in CXCR7 on βarr recruitment and endosomal trafficking. Taken together, our study provides molecular insights into intrinsic bias encoded in the CXCR4-CXCR7 system, and it has broad implications for therapeutically important framework of biased agonism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetChemokine receptors and signalingTravaux en français237 207