MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4281776466 · doi:10.21203/rs.3.rs-1719039/v1

TGF-β regulates m 6 A RNA methylation after PM 2.5 exposure

2022· preprint· en· W4281776466 sur OpenAlexfundno aff
Kaibing Xue, Zhigang Li, Yuanxun Zhang, Ning Tang, Yongjie Wei

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of ChinaInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesKanazawa UniversityInstitute of Nature and Environmental Technology, Kanazawa University
Mots-clésMethylationRNA methylationMethyltransferaseRNAEpigeneticsDNA methylationBiologyTransforming growth factorMolecular biologyDownregulation and upregulationCell biologyGene expressionChemistryCancer researchBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Atmospheric particulate matter exposure has adverse effects on human health, but its molecular mechanism is complex and need to be explored in depth over time. m6A RNA methylation is an important epigenetic modification that regulates gene expression at the post-transcriptional level. Our previous animal exposure studies found that PM2.5 exposure up-regulated m6A RNA methylation in lung, but the regulatory pathway is currently unclear. PM2.5 can activate transforming growth factor-β (TGF-β), and Smad2/3, a downstream factor of TGF-β, can affect m6A RNA methylation by binding to the RNA methyltransferase complex. Based on the above evidences, the current study aimed to investigate the role of TGF-β signal pathway in PM2.5-induced m6A RNA methylation through animal and A549 cell exposure model. Our results showed that PM2.5 could induce upregulation of m6A RNA methylation, accompanied by increased expression of TGF-β, Smad3, methyltransferase-like 3 (METTL3), methyltransferase-like 14 (METTL14) in both lungs of mice and A549 cell line. Furthermore, the TGF-β inhibition cellular experiments determined that PM2.5 exposure altered the level of m6A RNA methylation, expression of TGF-β, Smad3. Accordingly, it is clear that TGF-β plays an indispensable role in m6A RNA methylation after PM2.5 exposure. Our study demonstrates that PM2.5 exposure influence RNA m6A methylation through the TGF-β signal pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch SquareMême sujetRNA modifications and cancerTravaux en français237 207