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Enregistrement W4281978051 · doi:10.1152/ajpregu.00188.2021

Metabolic consequences of PGC-1α dysregulation in adult zebrafish muscle

2022· article· en· W4281978051 sur OpenAlexafffund
Nicholas W. Kurchaba, J. Michael Charette, Christophe M. R. LeMoine

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensChildren's Hospital Research Institute of ManitobaCancerCare ManitobaBrandon University
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of CanadaBrandon University
Mots-clésBiologyZebrafishSkeletal muscleCell biologyEnergy homeostasisMyocyteRegulation of gene expressionMitochondrionEndocrinologyReceptorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The peroxisome proliferator-activated receptor γ coactivator 1 α (PGC-1α) is central to the regulation of cellular and mitochondrial energy homeostasis in mammals, but its role in other vertebrates remains unclear. Indeed, previous work suggests extensive structural and functional divergence of PGC-1α in teleosts but this remains to be directly tested. Here, we describe the initial characterization of heterozygous PGC-1α mutant zebrafish lines created by CRISPR-Cas9 disruptions of an evolutionarily conserved regulatory region of the PGC-1α proximal promoter. Using qPCR, we confirmed the disruption of PGC-1α gene expression in striated muscle, leading to a simultaneous fourfold increase in mixed skeletal muscle PGC-1α mRNA levels and an opposite fourfold downregulation in cardiac muscle. In mixed skeletal muscle, most downstream effector genes were largely unaffected yet two mitochondrial lipid transporters, carnitine palmitoyltransferase-1 and -2, were strongly induced. Conversely, PGC-1α depression in cardiac muscle reduced the expression of several transcriptional regulators (estrogen-related receptor α, nuclear respiratory factor 1, and PGC-1β) without altering metabolic gene expression. Using high-resolution respirometry, we determined that white muscle exhibited increased lipid oxidative capacity with little difference in markers of mitochondrial abundance. Finally, using whole animal intermittent respirometry, we show that mutant fish exhibit a twofold higher basal metabolism than their wild-type counterparts. Altogether, this new model confirms a central but complex role for PGC-1α in mediating energy utilization in zebrafish, and we propose its use as a valuable tool to explore the intricate regulatory pathways of energy homeostasis in a popular biomedical model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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