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Enregistrement W4282542011 · doi:10.1038/s42003-022-03448-z

Differential and shared genetic effects on kidney function between diabetic and non-diabetic individuals

2022· review· en· W4282542011 sur OpenAlexaff
Thomas W. Winkler, Humaira Rasheed, Alexander Teumer, Mathias Gorski, Bryce Rowan, Kira J. Stanzick, Laurent F. Thomas, Adrienne Tin, Anselm Hoppmann, Audrey Y. Chu, Bamidele O. Tayo, Chris H. L. Thio, Daniele Cusi, Jin Fang Chai, Karsten B. Sieber, Katrin Horn, Man Li, Markus Scholz, Massimiliano Cocca, Matthias Wuttke, Peter J. van der Most, Qiong Yang, Sahar Ghasemi, Teresa Nutile, Yong Li, Giulia Pontali, Felix Günther, Abbas Dehghan, Adolfo Correa, Afshin Parsa, Agnese Feresin, Aiko P. J. de Vries, Alan B. Zonderman, Albert V. Smith, Albertine J. Oldehinkel, Alessandro De Grandi, Alexander R. Rosenkranz, André Franke, Andrej Teren, Andres Metspalu, Andrew A. Hicks, Andrew P. Morris, Anke Tönjes, Anna Morgan, Anna Podgornaia, Annette Peters, Antje Körner, Anubha Mahajan, Archie Campbell, Barry I. Freedman, Beatrice Spedicati, Belén Ponte, Ben Schöttker, Ben Brumpton, Bernhard Banas, Bernhard K. Krämer, Bettina Jung, Bjørn Olav Åsvold, Blair H. Smith, Boting Ning, Brenda W.J.H. Penninx, Brett Vanderwerff, Bruce M. Psaty, Candace M. Kammerer, Carl D. Langefeld, Caroline Hayward, Cassandra N. Spracklen, Cassianne Robinson‐Cohen, Catharina A. Hartman, Cecilia M. Lindgren, Chaolong Wang, Charumathi Sabanayagam, Chew‐Kiat Heng, Chiara Lanzani, Chiea Chuen Khor, Ching‐Yu Cheng, Christian Fuchsberger, Christian Gieger, Christian M. Shaffer, Christina‐Alexandra Schulz, Cristen J. Willer, Daniel I. Chasman, Daníel F. Guðbjartsson, Daniela Ruggiero, Daniela Toniolo, Darina Czamara, David J. Porteous, Dawn Waterworth, Deborah Mascalzoni, Dennis O. Mook‐Kanamori, Dermot F. Reilly, E. Warwick Daw, Edith Hofer, Eric Boerwinkle, Erika Salvi, Erwin P. Böttinger, E Shyong Tai, Eulalia Catamo, Federica Rizzi, Feng Guo, Fernando Rivadeneira, Franco Guilianini, Garðar Sveinbjörnsson, Georg Ehret, Gérard Waeber, Ginevra Biino, Giorgia Girotto, Giorgio Pistis, Girish N. Nadkarni, Graciela E. Delgado, Grant W. Montgomery, Harold Snieder, Harry Campbell, Harvey D. White, He Gao, Heather M. Stringham, Helena Schmidt, Hengtong Li, Hermann Brenner, Hilma Hólm, Holgen Kirsten, Holly Kramer, Igor Rudan, Ilja M. Nolte, Ioanna Tzoulaki, Ísleifur Ólafsson, Jade Martins, James P. Cook, James F. Wilson, Jan Halbritter, Janine F. Felix, Jasmin Divers, Jaspal S. Kooner, Jeannette Jen-Mai Lee, Jeffrey R. O’Connell, Jerome I. Rotter, Jianjun Liu, Jie Xu, Joachim Thiery, Johan Ärnlöv, Johanna Kuusisto, Jóhanna Jakobsdóttir, Johanne Tremblay, John C. Chambers, John B. Whitfield, John Michael Gaziano, Jonathan Marten, Josef Coresh, Jost B. Jonas, Josyf C. Mychaleckyj, Kaare Christensen, Kai‐Uwe Eckardt, Karen L. Mohlke, Karlhans Endlich, Katalin Dittrich, Kathleen A. Ryan, Kenneth Rice, Kent D. Taylor, Kevin Ho, Kjell Nikus, Koichi Matsuda, Konstantin Strauch, Kozeta Miliku, Kristian Hveem, Lars Lind, Lars Wallentin, Laura M. Yerges-Armstrong, Laura M. Raffield, Lawrence S. Phillips, Lenore J. Launer, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Leslie A. Lange, Lorena Citterio, Lucija Klarić, M. Arfan Ikram, Marcus Ising, Marcus E. Kleber, Margherita Francescatto, Maria Pina Concas, Marina Ciullo, Mario Piratsu, Marju Orho‐Melander, Markku Laakso, Markus Loeffler, Markus Perola, Martin H. de Borst, Martin Gögele, Martina La Bianca, Mary Ann Lukas, Mary F. Feitosa, Mary L. Biggs, Mary K. Wojczynski, Maryam Kavousi, Masahiro Kanai, Masato Akiyama, Masayuki Yasuda, Matthias Nauck, Mélanie Waldenberger, Miao-Li Chee, Miao-Ling Chee, Michael Boehnke, Michael Preuß, Michael Stümvoll, Michael A. Province, Michele K. Evans, Michelle L. O’Donoghue, Michiaki Kubo, Mika Kähönen, Mika Kastarinen, Mike A. Nalls, Mikko Kuokkanen, Mohsen Ghanbari, Murielle Bochud, Navya Shilpa Josyula, Nicholas G. Martin, Nicholas Tan, Nicola Pirastu, Nicole Schupf, Niek Verweij, Nina Hutri‐Kähönen, Nina Mononen, Nisha Bansal, Olivier Devuyst, Olle Melander, Olli T. Raitakari, Ozren Polašek, Paolo Manunta, Paolo Gasparini, Pashupati P. Mishra, Patrick Sulem, Patrik K. E. Magnusson, Paul Elliott, Paul M. Ridker, Pavel Hamet, Per Svensson, Peter K. Joshi, Péter Kovács, Peter P. Pramstaller, Peter Rossing, Péter Vollenweider, Pim van der Harst, Rajkumar Dorajoo, Ralene Sim, Ralph Burkhardt, Ran Tao, Raymond Noordam, Reedik Mägi, Reinhold Schmidt, Renée de Mutsert, Rico Rueedi, Rob M. van Dam, Robert J. Carroll, Ron T. Gansevoort, Ruth J. F. Loos, Sanaz Sedaghat, Sandosh Padmanabhan, Sandra Freitag‐Wolf, Sarah A. Pendergrass, Sarah E. Graham, Scott D. Gordon, Shih‐Jen Hwang, Shona M. Kerr, Simona Vaccargiu, Snehal Patil, Stein Hallan, Stephan J. L. Bakker, S. M. L. Lim, Susanne Lucae, Suzanne Vogelezang, Sven Bergmann, Tanguy Corre, Tarunveer S. Ahluwalia, Terho Lehtimäki, Thibaud Boutin, Thomas Meitinger, Tien Yin Wong, Tobias Bergler, Ton J. Rabelink, Tõnu Esko, Toomas Haller, Unnur Þorsteinsdóttir, Uwe Völker, Valencia Hui Xian Foo, Veikko Salomaa, Véronique Vitart, Vilmantas Giedraitis, Vilmundur Guðnason, Vincent W. V. Jaddoe, Wei Huang, Weihua Zhang, Wen Bin Wei, Wieland Kieß, Winfried März, Wolfgang Köenig, Wolfgang Lieb, Xin Gao, Xueling Sim, Ya Xing Wang, Yechiel Friedlander, Yih Chung Tham, Yoichiro Kamatani, Yukinori Okada, Yuri Milaneschi, Zhi Yu, Klaus Stark, Kāri Stefánsson, Carsten A. Böger, Florian Kronenberg, Anna Köttgen, Cristian Pattaro, Iris M. Heid

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMedpharmgene (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthNovo Nordisk FondenDeutsche ForschungsgemeinschaftU.S. Department of Veterans AffairsNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilOffice of Research and DevelopmentSteno Diabetes Center CopenhagenWellcome Trust
Mots-clésDifferential (mechanical device)Diabetes mellitusRenal functionMedicineInternal medicineEndocrinologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Reduced glomerular filtration rate (GFR) can progress to kidney failure. Risk factors include genetics and diabetes mellitus (DM), but little is known about their interaction. We conducted genome-wide association meta-analyses for estimated GFR based on serum creatinine (eGFR), separately for individuals with or without DM (n DM = 178,691, n noDM = 1,296,113). Our genome-wide searches identified (i) seven eGFR loci with significant DM/noDM-difference, (ii) four additional novel loci with suggestive difference and (iii) 28 further novel loci (including CUBN ) by allowing for potential difference. GWAS on eGFR among DM individuals identified 2 known and 27 potentially responsible loci for diabetic kidney disease. Gene prioritization highlighted 18 genes that may inform reno-protective drug development. We highlight the existence of DM-only and noDM-only effects, which can inform about the target group, if respective genes are advanced as drug targets. Largely shared effects suggest that most drug interventions to alter eGFR should be effective in DM and noDM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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