Flaxseed Alters Gut Microbiota-Mammary Gland MicroRNA Relationships Differently Than its Oil and Lignan Components
Notice bibliographique
Résumé
Consumption of flaxseed (FS) and its oil (FSO) and lignan (secoisolariciresinol diglucoside, SDG) components have been associated with changes during mammary gland (MG) development which then lead to reduced breast cancer risk in adulthood. FS components are metabolized by the gut microbiota and MG microRNA (miRNA) response to FS may be an underlying mechanism. We aimed to determine if there is an association between the cecal microbiota and MG miRNome, if it is affected by FS or its components, and to identify altered pathways. We used MG miRNome (NanoString nCounterâ system) and cecal microbiota (16S rRNA gene sequencing) data from our previous study where 4–5 week old female C57BL/6 mice were randomized to receive one of four isocaloric diets (n = 5–6/group): basal AIN-93G diet (BD), 10% FS, 3.67% FSO, and 0.15% SDG for 3 weeks. Within-group Spearman correlations between paired (by mouse) miRNA and bacterial genera were compared across the 4 conditions by Differential Correlation Analysis (DGCA v1.0.2 R Package). Genes targeted by miRNA in significantly (q < 0.15) altered correlations were identified with miRDB v6.0 and used for pathway analysis (pathDIP 4, Bonferroni adjusted p-value < 0.05). 619,541, 811, and 768 significant miRNA-genera correlations were found in the BD, FS, FSO, and SDG groups, respectively. FS reversed 24 of the BD within-group correlations, but FSO or SDG did not. SDG reversed 24 of the FS within-group correlations, but FSO did not. Of correlations reversed by FS when compared to BD, enriched pathways of miRNA gene targets included cadherin and Wnt signalling, processes vital to MG development, tumour formation and metastasis. When comparing SDG correlations to FS, involved pathways were related to MG development, tumour initiation and progression. There is a relationship between gut microbial taxa and MG miRNAs, which is modified by FS. This suggests that the microbiota is a mediator of FS miRNA-dependent effects in the MG. SDG, but not FSO, may participate in FS effects but it does not influence microbial genera-miRNA relationships alone. This suggests that whole FS consumption is necessary for benefits in MG development and breast cancer risk via cecal microbiota-MG miRNA mechanisms. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».