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Enregistrement W4282843208 · doi:10.15252/emmm.202115608

Functional divergence of the two Elongator subcomplexes during neurodevelopment

2022· article· en· W4282843208 sur OpenAlexaff
Monika Gaik, Marija Kojic, Megan R Stegeman, Tülay Öncü Öner, Anna Kościelniak, Alun Jones, Ahmed Mohamed, Pak Yan Stefanie Chau, Sazia Sharmin, Andrzej Chramiec‐Głąbik, Paulina Indyka, Michał Rawski, Anna Biela, Dominika Dobosz, Amanda Millar, Vann Chau, Aycan Ünalp, Michael Piper, Mark C. Bellingham, Evan E. Eichler, Deborah A. Nickerson, Handan Güleryüz, Nour-el-Hana Abbassi, Konrad Jazgar, Melissa J. Davis, Saadet Mercimek‐Andrews, Sultan Cingöz, Brandon J. Wainwright, Sebastian Glatt

Notice bibliographique

RevueEMBO Molecular Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of AlbertaSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNational Human Genome Research InstituteCenter for Mendelian Genomics, University of WashingtonUniwersytet Jagielloński w KrakowieTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuNational Institutes of HealthDokuz Eylül ÜniversitesiEuropean CommissionFundacja na rzecz Nauki PolskiejNational Institute of Mental HealthAustralian GovernmentNational Heart, Lung, and Blood InstituteInfrastruktura PL-GridUniversity of Washington
Mots-clésConceptualizationLibrary scienceData curationVisualizationComputer scienceWorld Wide WebData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The highly conserved Elongator complex is a translational regulator that plays a critical role in neurodevelopment, neurological diseases, and brain tumors. Numerous clinically relevant variants have been reported in the catalytic Elp123 subcomplex, while no missense mutations in the accessory subcomplex Elp456 have been described. Here, we identify ELP4 and ELP6 variants in patients with developmental delay, epilepsy, intellectual disability, and motor dysfunction. We determine the structures of human and murine Elp456 subcomplexes and locate the mutated residues. We show that patient-derived mutations in Elp456 affect the tRNA modification activity of Elongator in vitro as well as in human and murine cells. Modeling the pathogenic variants in mice recapitulates the clinical features of the patients and reveals neuropathology that differs from the one caused by previously characterized Elp123 mutations. Our study demonstrates a direct correlation between Elp4 and Elp6 mutations, reduced Elongator activity, and neurological defects. Foremost, our data indicate previously unrecognized differences of the Elp123 and Elp456 subcomplexes for individual tRNA species, in different cell types and in different key steps during the neurodevelopment of higher organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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