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The GA4GH Phenopacket schema defines a computable representation of clinical data
Julius O.B. Jacobsen, Michael Baudis, Gareth Baynam, J. Beckmann, Sergi Beltrán, Orion J. Buske, Tiffany J. Callahan, Christopher G. Chute, Mélanie Courtot, Daniel Daniš, Olivier Elemento, Andrea Essenwanger, Robert R. Freimuth, Michael Gargano, Tudor Groza, Ada Hamosh, Nomi L. Harris, Rajaram Kaliyaperumal, K. C. Kent Lloyd, Aly Khalifa, Peter Krawitz, Sebastian Köhler, Bryan Laraway, Heikki Lehväslaiho, Leslie Matalonga, Julie A. McMurry, Alejandro Metke‐Jimenez, Chris Mungall, Mónica Muñoz-Torres, Soichi Ogishima, Anastasios Papakonstantinou, Davide Piscia, Nikolas Pontikos, Núria Queralt-Rosiñach, Marco Roos, Julian Saß, Paul N. Schofield, Dominik Seelow, Anastasios Siapos, Damian Smedley, Lindsay Smith, Robin Steinhaus, Jagadish Chandrabose Sundaramurthi, Emilia M. Swietlik, Sylvia Thun, Nicole Vasilevsky, Alex H. Wagner, Jeremy L. Warner, Claus Weiland, Myles Axton, Lawrence Babb, Cornelius F. Boerkoel, Bimal P. Chaudhari, Hui‐Lin Chin, Michel Dumontier, Nour Gazzaz, Harry Hochheiser, Veronica A. Kinsler, Hanns Lochmüller, Alexander Mankovich, Gary Saunders, Panagiotis I. Sergouniotis, Rachel Thompson, Andreas Zankl, Melissa Haendel, Peter N. Robinson
Notice bibliographique
RevueNature Biotechnology · 2022
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of OttawaUniversity of British ColumbiaOntario GenomicsB.C. Women's Hospital & Health CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryUniversity of California Davis School of MedicineUniversity College LondonUniversité de LausanneNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteLeibniz-GemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchAnschutz Medical Campus, University of ColoradoNational Institutes of HealthGenome CanadaEuropean Molecular Biology LaboratoryAngela Wright Bennett FoundationNational Health and Medical Research CouncilVanderbilt UniversityMoorfields Eye CharityMoorfields Eye Hospital NHS Foundation TrustCommonwealth Scientific and Industrial Research OrganisationFaculty of Health and Medical Sciences, University of Western AustraliaEuropean Bioinformatics InstituteFreie Universität BerlinDepartment of Artificial Intelligence, Korea UniversityUniversität ZürichU.S. Department of Health and Human ServicesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentHumboldt-Universität zu BerlinAustralian e-Health Research CentreAlan Turing InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilLeids Universitair Medisch CentrumUniversiteit LeidenUniversity of ConnecticutWeill Cornell Medical CollegeQueen Mary University of LondonNational Institute for Health and Care ResearchStan Perron Charitable FoundationUniversitat Pompeu FabraWellcome TrustUniversitat de BarcelonaOhio State UniversityBarcelona Institute of Science and TechnologyChina Scholarship CouncilJapan Agency for Medical Research and DevelopmentJohns Hopkins UniversityMcCusker Charitable FoundationBerlin Institute of HealthNationwide Children's HospitalU.S. Department of Energy
Mots-clésSchema (genetic algorithms)Representation (politics)Computer scienceInformation retrievalPolitical science
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,234
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations111
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentnon