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Enregistrement W4282926266 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-3524

Abstract 3524: Role of the gut microbiota in the development of immune-mediated diarrhea and colitis induced by immune checkpoint inhibitors

2022· article· en· W4282926266 sur OpenAlexaff
Khoudia Diop, Myriam Benlaïfaoui, Wiam Belkaïd, Alexis Nolin-Lapalme, Julie Malo, Marion Tonneau, Mayra Ponce, Afnan Al-Saleh, Catalin Mihalcioiu, Ian R. Watson, Arielle Elkrief, Karla Lee, Meriem Messaoudene, Bertrand Routy, Corentin Richard

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemMicrobiomeColitisMetagenomicsBiologyGut floraEnterococcus faeciumImmunologyLactobacillusBiomarkerDiarrheaFecesMicrobiologyBacteriaInternal medicineMedicineBioinformaticsBiochemistryAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The accelerating use of combined immune checkpoint inhibitors (ICI; anti-PD-1 plus anti-CTLA-4 antibodies) enhanced therapeutic responses in various cancers while significantly increasing immune-related adverse events (irAE). The mechanism involved in the occurrence of immune-mediated diarrhea and colitis (IMDC) and its potential implication on ICI efficacy remain unclear. The gut microbiome is progressively recognized as a key biomarker of ICI efficacy and preliminary results suggest its potential association with irAE. However, the link between microbiota and IMDC still needs to be elucidated. In this study, we investigated IMDC-associated intestinal bacteria.We performed metagenomics sequencing of baseline pre-ICI fecal samples from 26 advanced melanoma patients and recorded IMDC. Culturomics using MALDI-TOF was used to isolate bacteria from 19 patient samples: 11 IMDC-free (fIMDC), 5 baseline pre-IMDC (pIMDC) and 8 during IMDC (dIMDC). Serum multiplex cytokine panel was measured for 36 patients. Then, we induced colitis with Dextran Sulfate Sodium (DSS) in MCA-205 murine tumor model treated with oral supplementation of human bacteria and ICI.Metagenomics profiling demonstrated lower α-diversity at baseline in patients that developed irAE. Moreover, pIMDC samples present a lower Simpson α-diversity than fIMDC samples (p=0.08). ß-diversity was also different between both groups (p=0.10) suggesting a different baseline microbiome composition. Lefse analysis revealed an overrepresentation of Enterococcus faecium and Bilophila wadsworthia in pIMDC samples compared to fIMDC samples. Culturomics showed that dIMDC samples exhibited a shift in gut microbiota with a significant decrease in bacterial diversity mostly anaerobic species and an enrichment of Clostridium paraputricum, Clostridium perfringens, Paraclostridium bifermentans and Paeniclostridium sordelii compared to fIMDC and pIMDC samples. Immunological analysis of serum revealed that IMDC patients had a higher concentration of pro-inflammatory cytokines including GMCSF (p=0.04), IL12-23p40 (p=0.04) and IL-16 (p=0.03) compared to fIMDC patients. In our DSS-induced colitis mouse model, we showed that P. bifermentans oral supplementation related with diarrhea and a shorter colon length, indicating more severe colitis. Moreover, we showed that P. bifermentans increased anti-CLTA-4 and anti-PD-1 anti-tumor activity.Results showed that gut microbiota composition of dIMDC patients differed from that of pIMDC and fIMDC patients with a decrease of diversity and colonization of P.bifermentans and P.sordelii. In IMDC patients, we isolated bacteria that aggravated colitis in murine models and are known to be associated with inflammatory bowel disease. These results provide more insight on potential microbiome-modifying strategies to damper IMDC and increase anti-cancer efficacy. Citation Format: Khoudia Diop, Benlaïfaoui Myriam, Wiam Belkaïd, Alexis Nolin-Lapalme, Julie Malo, Marion Tonneau, Ponce Mayra, Afnan Al-Saleh, Catalin Mihalcioiu, Ian Watson, Arielle Elkrief, Karla Lee, Meriem Messaoudene, Bertrand Routy, Corentin Richard. Role of the gut microbiota in the development of immune-mediated diarrhea and colitis induced by immune checkpoint inhibitors [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 3524.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
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