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Enregistrement W4282929212 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-2436

Abstract 2436: CIRBP is a functional mediator of leptomeningeal metastasis

2022· article· en· W4282929212 sur OpenAlexaff
Rima Ezzeddine, Matthew Dankner, Paul Savage, Steven Hébert, William Brothers, Matthew G. Annis, Sarah M. Maritan, Marc R. Fabian, Claudia L. Kleinman, Morag Park, Peter M. Siegel

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchMedicinePathologyCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Cold-Inducible RNA Binding Protein (CIRBP) has been implicated in cancer initiation. Moreover, we have previously identified an association of CIRBP with the invasive growth of parenchymal brain metastases. Using a patient-derived xenograft (PDX) model, in which cells implanted in the mouse mammary fat pad spontaneously metastasize to the leptomeninges, we identified CIRBP as being elevated in leptomeningeal metastases (LM) compared to matched primary mammary tumors. LM grow in the subarachnoid space that harbors the cerebral spinal fluid (CSF). The leptomeninges represent an inhospitable environment for disseminated cancer cells since the CSF is mitogen and nutrient poor. To investigate the importance of CIRBP for metastatic breast cancer cells in the leptomeninges, we stably reduced CIRBP expression in MDA-MB-231 cells and performed mammary fat pad and cranial injections. CIRBP knockdown had no influence on primary tumor growth, but diminished growth within the brain. Hypothesis: We hypothesize that CIRBP functions as a stress response protein enabling cancer cells to grow in the harsh environment of the CSF. Results: In response to various cellular stressors, such as hypothermia, hypoxia or UV irradiation, CIRBP can translocate from the nucleus to the cytoplasm. We show that culturing MDA-MB-231 cells in artificial CSF (aCSF) also causes CIRBP relocation from nucleus to cytoplasm. Using RNA-IP approaches, we have identified mRNAs bound by CIRBP in breast cancer cells treated with aCSF. Ultimately, we will determine whether any of the identified CIRBP-regulated targets contribute to the formation of LM. Finally, we have generated CIRBP variants that are confined either to the nucleus or the cytoplasm. We are currently assessing the ability of these compartment-restricted CIRBP proteins to promote the formation of central nervous system metastases. Conclusions: We have identified CIRBP as a promoter of leptomeningeal metastasis. Our results have begun to reveal the mechanisms through which CIRBP mediates this process. Citation Format: Rima Ezzeddine, Matthew Dankner, Paul Savage, Steven Hebert, William Brothers, Matthew G. Annis, Sarah M. Maritan, Marc R. Fabian, Claudia Kleinman, Morag Park, Peter M. Siegel. CIRBP is a functional mediator of leptomeningeal metastasis [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 2436.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
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