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Enregistrement W4282930742 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-2148

Abstract 2148: Pre-clinical models recapitulating the spectrum of response of BRCA associated pancreatic cancer

2022· article· en· W4282930742 sur OpenAlexaff
Talia Golan, Chani Stossel, Maria Raitses-Gurevitch, Dikla Atias, Tamar Beller, Steven Gallinger, Raanan Berger

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyPancreatic cancerCancerInternal medicineCancer researchClinical trialPARP inhibitorDiseaseBiologyPoly ADP ribose polymeraseGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a dismal disease, with the majority of patients diagnosed at an advanced stage. Comprehensive genomic analysis identified the homologous recombination deficiency (HRD) subgroup which is predominantly enriched in patients harboring germline BRCA1/2 mutations (glBRCA) and presents ~7% and up to 15% in selected high-risk populations. Tumors with HRD are susceptible to DNA-damaging agents and PARP inhibition. However, not all patients demonstrate a similar response, and a spectrum is observed. We analyzed the clinical outcome of ninety-one glBRCA PDAC patients treated at Sheba Medical Center. We identify three main subgroups of response spanning from ~25% patients refractory to first line platinum agents and ~9% patients with durable long-term response with no evidence of disease for over three years. The majority of the patients display a prolonged response to platinum and PARPi maintenance (>24 months) followed by acquired resistance. We generated patient derived xenograft (PDX) models and an ex-vivo culture system (EVOC) from naïve to treatment tissue and at clinical resistance. In vivo efficacy to platinum agents and PARPi demonstrates that these models recapitulate the specific clinical spectrum of response. We demonstrate the utility of both pre-clinical models in their ability to predict response to platinum-based agents and PARPi, with EVOC having a potential to assist in medical decisions while treating the patient. Whole genome sequencing of the tumors revealed that BRCA monoallelic tumors are associated with innate resistance while biallelic tumors reflect sensitivity to platinum agents and PARPi. In the acquired resistance models, the main identified mechanism of resistance was due to reversion mutations in 4/6 of samples. Whole genome analysis demonstrates high mutational and neo-antigen load in majority of the glBRCA tumors. In a preliminary study, we show the efficacy of anti PD1 in a novel humanized glBRCA PDAC PDX model. This extensive preclinical and clinical collection of BRCA associated PDAC, enables further understanding and investigation of this unique subtype in aim to develop alternative treatments to overcome resistance. Citation Format: Talia Golan, Chani Stossel, Maria Raitses-Gurevitch, Dikla Atias, Tamar Beller, Steven Gallinger, Raanan Berger. Pre-clinical models recapitulating the spectrum of response of BRCA associated pancreatic cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 2148.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
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