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Enregistrement W4282934712 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-1361

Abstract 1361: Crosstalk between peripherally expanded T cells and Tfh-like cells in shaping effector functions of CD8 T cells in ovarian cancer

2022· article· en· W4282934712 sur OpenAlexaff
Mayra Carneiro, Paméla Thébault, Yacine Barèche, Kurosh Rahimi, Jean‐François Cailhier, Anne‐Marie Mes‐Masson, John Stagg, Sophie Petropoulos, Réjean Lapointe

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytotoxic T cellOvarian cancerCancer researchCD8Immune checkpointImmune systemTumor microenvironmentGranzymeBiologyPerforinImmunologyT cellCancerImmunotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Immune checkpoint blockade (ICB) of PD-1 and/or CTLA-4 can induce long-lasting clinical responses in several neoplasias. However, despite the successful response in some cancer, it is still ineffective for other malignant lesions such as ovarian cancer. Studies on T cell dynamics demonstrated that antitumor immune response from ICB is mediated by clonal replacement of CD8 T cells. Moreover, the presence of clones expanded in both tumor and peripheral tissue, also called dual-expanded, can predict response to ICB. To understand T cell dynamics in ovarian cancer, we characterized intratumoral and peripheral immune cells by single-cell transcriptome and TCR-sequencing. Methods and results: Using the 5’ Chromium assay (10X Genomics) on CD45+ cells isolated from 5 naïve-treatment patients undergoing cytoreductive surgery, we identified T cell states and classified clones by location (blood or tumor) and expansion pattern. In addition, the data revealed that clones expanded within the tumor were terminally exhausted (upregulation of PDCD1, HAVCR2, CTLA4, ENTPD1, and CXCL13 genes), while dual-expanded clones (expanded in blood and tumor) upregulated genes associated with the cytotoxic function of CD8 T cells, such as granzymes (GZMA and GZMB) and perforin (PRF1). Considering the importance of dual-expanded clones in antitumor immune response, we interrogated the cellular interactions they encountered in the tumor microenvironment. Using the tool NicheNet we identified IL21 as one of the top ligands mediating the interaction between dual-expanded clones and T follicular helper-like CD4+ cells (Tfh-like cells). Interestingly, the gene signature of Tfh-like cells showed that besides dual-expanded clones, these cells might attract other immune cells through CXCL13 and oxysterol metabolites. We identified B cells and plasmacytoid dendritic cells (pDCs) as the major cell types recruited by the CXCL13-CXCR5 axis and oxysterol-GPR183, respectively. Additionally, memory-like CD8 T cells were found to express GPR183, suggesting that a gradient of oxysterol might recruit them to a region defined by Tfh-like cells. Conclusions: Taken together, our study provides insights into additional functions of Tfh-like cells in the recruitment of immune cells through oxysterol gradient. A better understanding of the T cell dynamics and antitumor immune response can provide potential development of novel immunotherapy for the treatment of ovarian cancer. Citation Format: Mayra Carneiro, Cheng Zhao, Paméla Thébault, Yacine Bareche, Kurosh Rahimi, Jean-François Cailhier, Anne-Marie Mes-Masson, John Stagg, Sophie Petropoulos, Réjean Lapointe. Crosstalk between peripherally expanded T cells and Tfh-like cells in shaping effector functions of CD8 T cells in ovarian cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 1361.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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