MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4282942659 · doi:10.1038/s41746-022-00613-w

Prostate cancer therapy personalization via multi-modal deep learning on randomized phase III clinical trials

2022· article· en· W4282942659 sur OpenAlexaff
Andre Esteva, Jean Feng, Douwe van der Wal, Shih-Cheng Huang, Jeffry Simko, Sandy DeVries, Emmalyn Chen, Edward M. Schaeffer, Todd M. Morgan, Yilun Sun, Amirata Ghorbani, Nikhil Naik, Dhruv Nathawani, Richard Socher, Jeff M. Michalski, Mack Roach, Thomas M. Pisansky, Jedidiah M. Monson, Farah Naz, James A. Wallace, Michelle Ferguson, Jean-Paul Bahary, James Zou, Matthew P. Lungren, Serena Yeung, Ashley E. Ross, Michael Jonathan Kucharczyk, Luís Souhami, Leslie Ballas, Christopher A. Peters, Sandy Liu, Alexander G. Balogh, Pamela Randolph-Jackson, David L. Schwartz, M.R. Girvigian, Naoyuki G. Saito, Adam Raben, Rachel Rabinovitch, Khalil Katato, Howard M. Sandler, Phuoc T. Tran, Daniel E. Spratt, Stephanie L. Pugh, Felix Y. Feng, Osama Mohamad

Notice bibliographique

Revuenpj Digital Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensMcGill University Health CentreNova Scotia Cancer CentreCentre Hospitalier de l’Université de MontréalHorizon Health NetworkOccupational Cancer Research CentreSaint John Regional Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNRG Oncology
Mots-clésRandomized controlled trialModalProstate cancerPersonalizationClinical trialMedicineCancerMedical physicsComputer scienceArtificial intelligenceOncologyInternal medicineWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prostate cancer is the most frequent cancer in men and a leading cause of cancer death. Determining a patient's optimal therapy is a challenge, where oncologists must select a therapy with the highest likelihood of success and the lowest likelihood of toxicity. International standards for prognostication rely on non-specific and semi-quantitative tools, commonly leading to over- and under-treatment. Tissue-based molecular biomarkers have attempted to address this, but most have limited validation in prospective randomized trials and expensive processing costs, posing substantial barriers to widespread adoption. There remains a significant need for accurate and scalable tools to support therapy personalization. Here we demonstrate prostate cancer therapy personalization by predicting long-term, clinically relevant outcomes using a multimodal deep learning architecture and train models using clinical data and digital histopathology from prostate biopsies. We train and validate models using five phase III randomized trials conducted across hundreds of clinical centers. Histopathological data was available for 5654 of 7764 randomized patients (71%) with a median follow-up of 11.4 years. Compared to the most common risk-stratification tool-risk groups developed by the National Cancer Center Network (NCCN)-our models have superior discriminatory performance across all endpoints, ranging from 9.2% to 14.6% relative improvement in a held-out validation set. This artificial intelligence-based tool improves prognostication over standard tools and allows oncologists to computationally predict the likeliest outcomes of specific patients to determine optimal treatment. Outfitted with digital scanners and internet access, any clinic could offer such capabilities, enabling global access to therapy personalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,048
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0480,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,378 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations197
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuenpj Digital MedicineMême sujetRadiomics and Machine Learning in Medical ImagingTravaux en français237 207