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Enregistrement W4282947107 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-lb001

Abstract LB001: Identifying MAGE-A4-positive tumors for SPEAR T-cell therapies in HLA-A*02-eligible patients

2022· article· en· W4282947107 sur OpenAlexaff
Tianjiao Wang, Jean‐Marc Navenot, Stavros Rafail, Mark Carroll, Ruoxi Wang, Cheryl McAlpine, Swethajit Biswas, Francine Brophy, Erica Elefant, Paige Bayer, Sandra McGuigan, Dennis Williams, George R. Blumenschein, Marcus O. Butler, Jeffrey M. Clarke, Justin F. Gainor, Ramaswamy Govindan, Víctor Moreno, Janet Tu, David S. Hong

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman leukocyte antigenAntigenMedicineCancerOncologyImmunologyCancer researchInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autologous T-cells engineered with T-cell receptors (TCRs) targeting tumor antigens are promising therapies for metastatic solid cancers.1 Specific peptide enhanced affinity receptor (SPEAR) T-cell therapies are T-cells with engineered HLA-restricted TCRs that precisely target tumor cells with specific antigens, such as MAGE-A4 (a cancer testis antigen), presented on the surface by HLA molecules. In SPEAR T-cell clinical trials targeting MAGE-A4, a 2-step prescreen is done before enrolment. 1) Patients undergo HLA typing via a high-resolution (allelic, 4-digit) sequence-based assay, and those who are positive for the inclusion alleles (HLA-A*02:01P, 02:02P, 02:03P, 02:06P) and not positive for the exclusion allele A*02:05P are eligible. 2) Tumor MAGE-A4 testing is done via an immunohistochemical clinical trial assay (MAGE-A4+ cutoff: ≥30% tumor cell staining at ≥2+ intensity) in HLA-eligible patients. A screening protocol (NCT02636855) has been used in Phase 1 trials of first- and next-generation SPEAR T-cells targeting MAGE-A4 (NCT03132922, NCT04044859) with responses in multiple MAGE-A4+ tumors. As of November 19, 2021, 6,168 patients with 9 solid tumor types were screened at 32 sites across North America and Europe in this screening protocol; among which, 2,744 were HLA-eligible (eligibility rate: 45%, range per tumor type: 42%-55%). HLA-A*02:01 was the most frequent HLA-A*02 allele. Of these HLA-eligible patients, 1,549 had tumor tissues evaluable for MAGE-A4 expression; among which, 313 were MAGE-A4+ (MAGE-A4+ rate: 20%, range: 8%-54%) (Table). MAGE-A4 showed highest prevalence in synovial sarcoma and myxoid/round cell liposarcoma but was seen across all tumor types investigated. Our results will be discussed in the context of tumor histopathology, disease status, and demography. HLA and MAGE-A4 biomarker data will inform the therapeutic opportunities for SPEAR T-cells targeting MAGE-A4 in metastatic solid cancers. 1. D’Angelo et al. Cancer Discov. 2018;8:944. HLA eligibility and MAGE-A4 prevalence in a screening protocol (NCT02636855) Indication Esophageal cancer Esophagogastric junction cancer Gastric cancer Head and neck squamous cell carcinoma Non-small cell lung cancer Melanoma Ovarian cancer Urothelial cancer Synovial sarcoma and myxoid/round cell liposarcoma HLA screened (N) 284 228 271 601 3189 668 539 270 118 HLA eligible (%) 46 45 43 42 43 50 49 43 55 MAGE-A4 evaluable (N) 104 91 73 200 457 245 225 93 61 MAGE-A4 positive (%) 22 25 8 22 14 16 24 32 54 Citation Format: Tianjiao Wang, Jean-Marc Navenot, Stavros Rafail, Mark Carroll, Ruoxi Wang, Cheryl McAlpine, Swethajit Biswas, Francine Brophy, Erica Elefant, Paige Bayer, Sandra McGuigan, Dennis Williams, George Blumenschein, Marcus Butler, Jeffrey M. Clarke, Justin F. Gainor, Ramaswamy Govindan, Victor Moreno, Janet Tu, David S. Hong. Identifying MAGE-A4-positive tumors for SPEAR T-cell therapies in HLA-A*02-eligible patients [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr LB001.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,439
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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