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Enregistrement W4282966985 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-3046

Abstract 3046: A common gut commensal utilizes tryptophan to promote cancer via the aryl hydrocarbon receptor

2022· article· en· W4282966985 sur OpenAlexaff
Vrishketan Sethi, Junyi Tao, Saba Kurtom, Utpreksha Vaish, Farrukh Afaq, Shuan Zao, Xian Luo, Tejeshwar Jain, Prateek Sharma, Ejas Palathingal Bava, Sundaram Ramakrishnan, Liang Li, Ashok K. Saluja, Vikas Dudeja

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGut floraAryl hydrocarbon receptorCancerBiologyAntibioticsRuminococcusFecesMetabolitePhysiologyMicrobiologyPharmacologyImmunologyEndocrinologyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: We have previously showed that gut microbiota-depleting oral antibiotics decrease tumor growth in C57BL/6J mice via the immune system (Sethi et al, Gastroenterology, 2018). The gut microbiota, however, includes thousands of species producing numerous metabolites. The search for individual bacterial species and metabolites that can promote cancer continues. Methods: We studied the effects of common microbiota modulation techniques in C57BL/6 mice procured from various commercial vendors and injected subcutaneously with cancer cells. 16S rRNA gene sequencing and metabolomics analyses were used to identify the putative cancer-promoting species and metabolites. Results: Mice procured from The Jackson Laboratory (JAX mice) form larger tumors at baseline compared to mice procured from the Charles River Laboratories (CR mice). JAX mice have tumor promoting microbiota that can be targeted by oral antibiotics unlike CR mice. This tumor-promoting microbiota gets transferred from JAX to CR mice via cohousing or fecal microbiota transplant. In a preclinical trial, oral vancomycin slowed the growth of cancer in avatar mice gavaged with stools of some pancreatic cancer patients but not of others. Statistical analyses reveal that the gut of JAX mice hosts a common human gram-positive gut commensal Ruminococcus gnavus that is associated with increased cancer growth in those mice. Monocolonization of germ-free mice with R gnavus directly increases tumor growth. Similarly, feeding R gnavus, but not a control bacterial species, brings the baseline tumor kinetics of CR mice up to that of JAX mice. Our experiments reveal that R gnavus needs sufficient dietary tryptophan (Trp) to promote tumor growth and in turn, catabolizes Trp into various metabolites including the Aryl Hydrocarbon Receptor (AHR) ligand Tryptamine, which we find, is also tumor-promoting per se. The tumor-modulating effects of oral vancomycin, tryptophan catabolites and R gnavus are abolished when murine AHR is stimulated by an exogenous ligand or when it is knocked out. Finally, we find that Ly6G+ cells are essential in effecting these bacteria-cancer interactions. Conclusions: We present initial evidence on how a common gut commensal hijacks an essential dietary amino acid to promote cancer via the AHR. We also demonstrate the essential but underappreciated role that the source of animal procurement plays in studies involving cancer models. Citation Format: Vrishketan Sethi, Junyi Tao, Saba Kurtom, Utpreksha Vaish, Farrukh Afaq, Shuan Zao, Xian Luo, Tejeshwar Jain, Prateek Sharma, Ejas Bava, Sundaram Ramakrishnan, Liang Li, Ashok Saluja, Vikas Dudeja. A common gut commensal utilizes tryptophan to promote cancer via the aryl hydrocarbon receptor [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 3046.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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