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Enregistrement W4282982544 · doi:10.1158/1538-7445.am2022-844

Abstract 844: Germline <i>TP53</i> missense mutations at codon338 confer adult-onset cancer risk through weakened p53 protein oligomeric stability that impairs its tumor suppressive mechanisms

2022· article· en· W4282982544 sur OpenAlexaff
Nicholas W. Fischer, Jaime Turk, Noel Ong, Shili Duan, Lilia Kaustov, Christian P. Kratz, Kristian W. Pajtler, Raymond Kim, C.H. Arrowsmith, David Malkin

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of TorontoHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentrePrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationGermlineBiologyCancerCancer researchPhenotypeGermline mutationGeneticsMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pathogenic TP53 germline variants predispose carriers to a high lifelong cancer risk in Li-Fraumeni syndrome (LFS). LFS presents as a broad phenotypic spectrum with highly variable age-of-onset and tumor types. The mechanisms leading to these phenotypic differences remain largely unknown, and many less frequent variants are not clinically defined as pathogenic or benign. Two missense mutations in the tetramerization domain of the p53 protein, F338S and F338C, have recently been of clinical interest; however, they are currently classified as variants of uncertain significance. Normally, p53 assembles as a tetrameric complex to bind DNA and transcriptionally regulate the expression of target genes involved in the cellular response to stress, acting as a crucial barrier to malignant transformation. Alterations to p53 structure can therefore lead to malfunction and ultimately tumor formation. Our structural analysis of the tetramerization domain demonstrates that F338S and F338C have significantly lower thermal stability compared to the wildtype protein. Furthermore, our functional assessments of apoptosis and the suppression of colony formation indicate that both variants operate with reduced tumor suppressor activity, although they maintain near wildtype functionality. We anticipate that our results will help to better understand why these mutations cause a history of predominantly adult-onset cancers in the affected families and could justify refining surveillance measures for these individuals. Citation Format: Nicholas W. Fischer, Jaime Turk, Noel Ong, Shili Duan, Lilia Kaustov, Christian Kratz, Kristian Pajtler, Raymond Kim, Cheryl Arrowsmith, David Malkin. Germline TP53 missense mutations at codon338 confer adult-onset cancer risk through weakened p53 protein oligomeric stability that impairs its tumor suppressive mechanisms [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2022; 2022 Apr 8-13. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2022;82(12_Suppl):Abstract nr 844.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,074

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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