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Enregistrement W4283015563 · doi:10.1038/s41598-022-13345-4

A spatiotemporal multi-scale computational model for FDG PET imaging at different stages of tumor growth and angiogenesis

2022· article· en· W4283015563 sur OpenAlexaff
Farshad Moradi Kashkooli, Mohammad Amin Abazari, M. Soltani, Mehran Akbarpour Ghazani, Arman Rahmim

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueMathematical Biology Tumor Growth
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor microenvironmentAngiogenesisStandardized uptake valueIntracellularFluorodeoxyglucoseExtracellularExtracellular matrixTumor cellsChemistryPositron emission tomographyCancer researchBiologyMedicineNuclear medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A deeper understanding of the tumor microenvironment (TME) and its role in metabolic activity at different stages of vascularized tumors can provide useful insights into cancer progression and better support clinical assessments. In this study, a robust and comprehensive multi-scale computational model for spatiotemporal transport of F-18 fluorodeoxyglucose (FDG) is developed to incorporate important aspects of the TME, spanning subcellular-, cellular-, and tissue-level scales. Our mathematical model includes biophysiological details, such as radiopharmaceutical transport within interstitial space via convection and diffusion mechanisms, radiopharmaceutical exchange between intracellular and extracellular matrices by glucose transporters, cellular uptake of radiopharmaceutical, as well as its intracellular phosphorylation by the enzyme. Further, to examine the effects of tumor size by varying microvascular densities (MVDs) on FDG dynamics, four different capillary networks are generated by angiogenesis modeling. Results demonstrate that as tumor grows, its MVD increases, and hence, the spatiotemporal distribution of total FDG uptake by tumor tissue changes towards a more homogenous distribution. In addition, spatiotemporal distributions in tumor with lower MVD have relatively smaller magnitudes, due to the lower diffusion rate of FDG as well as lower local intravenous FDG release. Since mean standardized uptake value (SUVmean) differs at various stages of microvascular networks with different tumor sizes, it may be meaningful to normalize the measured values by tumor size and the MVD prior to routine clinical reporting. Overall, the present framework has the potential for more accurate investigation of biological phenomena within TME towards personalized medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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