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Enregistrement W4283030731 · doi:10.3389/fmars.2022.914095

Seasonal and Form-Specific Gene Expression Signatures Uncover Different Generational Strategies of the Pelagic Tunicate Salpa thompsoni During the Southern Ocean Winter

2022· article· en· W4283030731 sur OpenAlexaff
Svenja J. Müller, Katharina Michael, Ilenia Urso, Gabriele Sales, Cristiano De Pittà, Lavinia Suberg, Wiebke Weßels, Evgeny A. Pakhomov, Bettina Meyer

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensTula FoundationUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésTunicatePelagic zoneBiologyPeninsulaOverwinteringEcologyAbundance (ecology)Biomass (ecology)Oceanography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The pelagic tunicate Salpa thompsoni is recognized as a major metazoan grazer in the Southern Ocean. Long term observations show an increase in this species’ biomass and a southward shift in its distribution both of which are positively correlated with ocean warming and winter sea ice decline around the Antarctic Peninsula. However, our understanding on how salps adapt their life cycle to the extreme seasonality of the Southern Ocean and the putative differences between its two reproductive forms (aggregates, solitaries) is rudimentary. In particular, our current knowledge of whether and how S. thompsoni overwinter is limited, largely due to winter sampling constraints. In this study, we investigated the form-specific gene expression profiles of Salpa thompsoni during the austral autumn and winter. Between the seasons, genes related to translation showed the biggest difference in gene expression. We found more genes were upregulated in solitaries compared to aggregates, indicating a potentially form-specific overwintering strategy. Our data provide first insights into the seasonal and form-specific physiology of salps by considering their complex life cycle, thereby contributing to a more comprehensive understanding of the response of salps to seasonal changes in their environment and to anthropogenic induced global climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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