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Enregistrement W4283032870 · doi:10.5206/mase/14612

A mathematical model of quorum quenching in biofilm colonies and its potential role as an adjuvant for antibiotic treatment

2022· article· en· W4283032870 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueMathematics in Applied Sciences and Engineering · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFields Institute for Research in Mathematical Sciences
Mots-clésQuorum sensingQuorum QuenchingBiofilmAutoinducerChemistryAntibioticsAdjuvantQuenching (fluorescence)Biomass (ecology)MicrobiologyBacteriaBiophysicsBiological systemBiochemistryBiologyPhysicsEcologyFluorescence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We extend a previously presented mesoscopic (i.e. colony scale) mathematical model of the reaction of bacterial biofilms to antibiotics. In that earlier model, exposure to antibiotics evokes two responses: inactivation as the antibiotics kill the bacteria, and inducing a quorum sensing based stress response mechanism upon exposure to small sublethal dosages. To this model we add now quorum quenching as an adjuvant to antibiotic therapy. Quorum quenchers are modeled like enzymes that degrade the quorum sensing signal concentration. The resulting model is a quasilinear system of seven reaction-diffusion equations for the dependent variables volume fractions of upregulated (protected), downregulated (unprotected) and inert (inactive) biomass [particulate substances], and for concentrations of a growth promoting nutrient, antibiotics, quorum sensing signal, and quorum quenchers [dissolved substances]. The biomass fractions are subject to two nonlinear diffusion effects: (i) degeneracy, as in the porous medium equation, where biomass vanishes, and (ii) a super-diffusion singularity where as it attains its theoretically possible maximum. We study this model in numerical simulations. Our simulations suggest that for maximum efficacy quorum quenchers should be applied early on before quorum sensing induction in the biofilm can take place, and that an antibiotic strategy that by itself might not be successful can be notably improved upon if paired with quorum quenchers as an adjuvant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,805
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle