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Enregistrement W4283120139 · doi:10.1016/j.ebiom.2022.104111

Investigation of metabolomic biomarkers for childhood executive function and the role of genetic and dietary factors: The GUSTO cohort

2022· article· en· W4283120139 sur OpenAlexaff
Jian Huang, Evelyn Law, İbrahim Karaman, Keri McCrickerd, Anna Fogel, Mary Foong‐Fong Chong, Lourdes Mary Daniel, Patrícia Pelufo Silveira, Yap Seng Chong, Johan G. Eriksson, Michael J. Meaney, Jonathan Huang

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Medical Research CouncilNational Research Foundation SingaporeMinistry of Health -SingaporeAgency for Science, Technology and ResearchNational Research Foundation
Mots-clésLeucineMetaboliteMetabolomeMetabolomicsMedicineWorking memoryCohortMendelian randomizationBiologyCognitionGeneticsInternal medicineBioinformaticsGenotypeGenetic variantsAmino acidPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Few studies have investigated molecular biomarkers of specific executive function (EF) skills in children. We aimed to characterise the prospective associations between metabolome and multiple domains of EF using a bidirectional design. METHODS: This study was conducted within a longitudinal birth cohort, the Growing Up in Singapore Towards healthy Outcomes (GUSTO). Circulating levels of 165 metabolites were quantified using a nuclear magnetic resonance based metabolomics platform (n = 457 (∼6yrs) and n = 524 (∼8yrs)). Parent-reported EF was available for 495 children (∼7yrs). Multivariate linear regression was used to assess the metabolite-EF relationships. We examined the role of body composition, dietary factors, and genetics in the metabolite-EF associations. FINDINGS: Higher leucine level (∼6yrs) was associated with poorer EF (∼7yrs, Initiate (P = 0.003) and Working Memory (P = 0.004)). EF (∼7yrs) was not associated with leucine (∼8yrs). Importantly, we found weak evidence for associations of dietary factors (∼5yrs) with leucine (∼6yrs) and EF (∼7yrs). Each copy of C allele in rs1260326 (a leucine-related polymorphism) was associated with higher leucine level and poorer Initiate and Working Memory (P < 0.05). Amongst those with less strongly genetically influenced leucine, inverse association between leucine and cognitive regulation were weaker among those with higher BMI. INTERPRETATION: The observed association between higher leucine level and poorer EF may be determined by genetics and may not be easily amenable to dietary interventions. Further research is needed for validation and to understand mechanisms. FUNDING: Singapore National Research Foundation and Agency for Science, Technology and Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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