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Enregistrement W4283121599 · doi:10.1093/cid/ciac476

The<i>Staphylococcus aureus</i>Network Adaptive Platform Trial Protocol: New Tools for an Old Foe

2022· article· en· W4283121599 sur OpenAlexaff
Steven Y. C. Tong, Jocelyn Mora, Asha C Bowen, Matthew P. Cheng, Nick Daneman, Anna L. Goodman, George Heriot, Todd C. Lee, Roger Lewis, David Chien Lye, Robert K. Mahar, Julie Marsh, Anna McGlothlin, Zoe McQuilten, Susan C. Morpeth, David L. Paterson, David J. Price, Jason Roberts, James O. Robinson, Sebastiaan J. van Hal, Genevieve Walls, Steve Webb, Lyn Whiteway, Joshua S. Davis, Nick Anagnostou, Sophia Archuleta, Eugene Athan, Lauren Barina, Emma Best, Max Bloomfield, Jennifer Bostock, Carly L. Botheras, Philip N Britton, Hannah J. Burden, Anita J Campbell, Hannah Carter, Ka Lip Chew, Russel Lee Ming Chong, Geoffrey W. Coombs, Peter Daley, Jane C. Davies, Yael Dishon, Ravindra Dotel, Adrian Dunlop, Felicity Flack, Katie L. Flanagan, Hong Foo, Nesrin Ghanem‐Zoubi, Stefano Giulieri, Jennifer Grant, Dan Gregson, Stephen Guy, Amanda Gwee, Erica Hardy, Andrew Henderson, Benjamin P. Howden, Fleur Hudson, Jennie Johnstone, Shirin Kalimuddin, Dana de Kretser, Andrea Lay‐Hoon Kwa, Todd A. Lee, Amy Legg, Martin Llewelyn, Thomas Lumley, Derek R. MacFadden, Isabelle Malhamé, Michael Marks, Marianne Martinello, Gail Matthews, Colin McArthur, Genevieve McKew, Brendan McMullan, Eliza Milliken, Srinivas Murthy, Clare Nourse, Matthew O’Sullivan, Mical Paul, Neta Petersiel, Lina Petrella, Sarah Pett, Owen Robinson, Benedict D. Rogers, Benjamin R. Saville, Matthew Scarborough, Marc H. Scheetz, Oded Scheuerman, Kevin Schwartz, Simon Smith, Tom Snelling, Marta Soares, Christine Sommerville, Andrew J. Stewardson, Neil Stone, Archana Sud, Robert Tilley, R. Brigg Turner, Jonathan Underwood, Lesley Voss, Rachel Webb, Lynda Whiteway, Heather L. Wilson, Terence Wuerz

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill UniversityHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésMedicineStaphylococcus aureusProtocol (science)Staphylococcal infectionsMicrobiologyBacteriaBiologyGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus bloodstream (SAB) infection is a common and severe infectious disease, with a 90-day mortality of 15%-30%. Despite this, <3000 people have been randomized into clinical trials of treatments for SAB infection. The limited evidence base partly results from clinical trials for SAB infections being difficult to complete at scale using traditional clinical trial methods. Here we provide the rationale and framework for an adaptive platform trial applied to SAB infections. We detail the design features of the Staphylococcus aureus Network Adaptive Platform (SNAP) trial that will enable multiple questions to be answered as efficiently as possible. The SNAP trial commenced enrolling patients across multiple countries in 2022 with an estimated target sample size of 7000 participants. This approach may serve as an exemplar to increase efficiency of clinical trials for other infectious disease syndromes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,174
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,183
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,174
Score d'incertitude au seuil0,918

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1740,183
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0110,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0240,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations101
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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