MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4283168489 · doi:10.1152/physiolgenomics.00146.2021

Local and systemic transcriptomic responses from acute exercise induced muscle damage of the human knee extensors

2022· article· en· W4283168489 sur OpenAlexafffund
Eric A. Kirk, Christina A. Castellani, Timothy J. Doherty, Charles L. Rice, Shiva M. Singh

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesWestern UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésBiologySkeletal muscleTranscriptomeGene expressionMyocyteGeneInternal medicineEndocrinologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal muscle is adaptable to a direct stimulus of exercise-induced muscle damage (EIMD). Local muscle gene networks and systemic circulatory factors respond to EIMD within days, mediating anti-inflammation and cellular proliferation. Here we show in humans that local EIMD of one muscle group is associated with a systemic response of gene networks that regulate muscle structure and cellular development in nonlocal homologous muscle not directly altered by EIMD. In the nondominant knee extensors of seven males, EIMD was induced through voluntary contractions against an electric motor that lengthened muscles. Neuromuscular assessments, vastus lateralis muscle biopsies, and blood draws occurred 2 days prior and 1 and 2 days after the EIMD intervention. From the muscle and blood plasma samples, RNA-Seq measured transcriptome changes of differential expression using bioinformatic analyses. Relative to the time of the EIMD intervention, local muscle that was mechanically damaged had 475 genes differentially expressed, as compared with 33 genes in the nonlocal homologous muscle. Gene and network analysis showed that activity of the local muscle was related to structural maintenance, repair, and energetic processes, whereas gene and network activities of the nonlocal muscle (that was not directly modified by the EIMD) were related to muscle cell development, stress response, and structural maintenance. Altered expression of two novel miRNAs related to the EIMD response supported that systemic factors were active. Together, these results indicate that the expression of genes and gene networks that control muscle contractile structure can be modified in response to nonlocal EIMD in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,677
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhysiological GenomicsMême sujetMuscle Physiology and DisordersTravaux en français237 207