A pituitary gene network linking <i>vgll3</i> to regulators of sexual maturation in male Atlantic salmon
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Age at maturity is a key life history trait and a significant contributor to life history strategy variation. The maturation process is complex and influenced by genetic and environmental factors alike, but specific causes of variation in maturation timing remain elusive. In many species, the increase in the regulatory gonadotropin-releasing hormone 1 (GnRH1) marks the onset of puberty. Atlantic salmon, however, lack the gene encoding GnRH1, suggesting other regulatory factors are involved in the maturation process. Earlier research in Atlantic salmon has found a strong association between alternative alleles of vgll3 and maturation timing, making vgll3 a candidate reproductive axis gene regulator. Recently we reported strong induction of gonadotropin encoding genes ( fshb and lhb ) in the pituitary of male Atlantic salmon homozygous for the vgll3 allele linked with the early maturation allele ( E ). The induction of gonadotropins was accompanied by increased expression of their direct upstream regulators, c-jun and sf1 ( nr5a1b ) in the pituitary. In mammals, the transcriptional activation of c-jun and sf1 is also required for induction of fshb and lhb , however, GnRH1 is responsible for increased transcriptional activity of c-jun and sf1 . The absence of gnrh1 in salmon raises the possibility of the involvement of other regulators upstream of these factors. In this study, we investigated such a possibility through a stepwise approach for identifying a gene regulatory network (GRN) containing c-jun and sf1 and using the zebrafish coexpression database and transcription factor motif enrichment analysis. We found a GRN containing c-jun with predicted upstream regulators, e2f1, egr1, foxj1 and klf4 , which are also differentially expressed in the pituitary. Finally, we suggest a model for transcriptional regulation of c-jun and sf1 in the absence of gnrh1 in the pituitary, which may have broader implications across vertebrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».