MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4283277720 · doi:10.1159/000525578

Expression and Development of TARP γ-4 in Embryonic Zebrafish

2022· article· en· W4283277720 sur OpenAlexaff
Kazi Tanveer Ahmed, Md Ruhul Amin, Parastoo Razmara, Birbickram Roy, Ruiqi Cai, Jingfeng Tang, Xing‐Zhen Chen, Declan W. Ali

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Neuroscience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMorpholinoMauthner cellZebrafishAMPA receptorCell biologyBiologyGene knockdownNeurotransmissionTransmembrane proteinGlutamate receptorExcitatory postsynaptic potentialPatch clampReceptorNeuroscienceElectrophysiologyBiochemistryGeneticsCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fast excitatory synaptic transmission in the CNS is mediated by the neurotransmitter glutamate, binding to and activating AMPA receptors (AMPARs). AMPARs are known to interact with auxiliary proteins that modulate their behavior. One such family of proteins is the transmembrane AMPAR-related proteins, known as TARPs. Little is known about the role of TARPs during development or about their function in nonmammalian organisms. Here, we report on the presence of TARP γ-4 in developing zebrafish. We find that zebrafish express 2 forms of TARP γ-4: γ-4a and γ-4b as early as 12 h post-fertilization. Sequence analysis shows that both γ-4a and γ-4b shows great level of variation particularly in the intracellular C-terminal domain compared to rat, mouse, and human γ-4. RT-qPCR showed a gradual increase in the expression of γ-4a throughout the first 5 days of development, whereas γ-4b levels were constant until day 5 when levels increased significantly. Knockdown of TARP γ-4a and γ-4b via either splice-blocking morpholinos or translation-blocking morpholinos resulted in embryos that exhibited deficits in C-start escape responses, showing reduced C-bend angles. Morphant larvae displayed reduced bouts of swimming. Whole-cell patch-clamp recordings of AMPAR-mediated currents from Mauthner cells showed a reduction in the frequency of mEPCs but no change in amplitude or kinetics. Together, these results suggest that γ-4a and γ-4b are required for proper neuronal development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDevelopmental NeuroscienceMême sujetNeuroscience and Neuropharmacology ResearchTravaux en français237 207