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Enregistrement W4283328003 · doi:10.22203/ecm.v043a19

Macromolecular crowding enhances fibrillin-1 deposition in the extracellular matrix

2022· article· en· W4283328003 sur OpenAlexfundno aff
Brandon Satz‐Jacobowitz, Nandaraj Taye, SZ Karoulias, Dirk Hubmacher

Notice bibliographique

RevueEuropean Cells and Materials · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthMcGill University
Mots-clésFibrillinMacromolecular crowdingExtracellular matrixCell biologyElastinMicrofibrilCell cultureChemistryExtracellularBiophysicsIn vivoMacromoleculeBiologyBiochemistryPathologyMedicineBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biochemical and biophysical factors need consideration when modelling in vivo cellular behaviour using in vitro cell culture systems. One underappreciated factor is the high concentration of macromolecules present in vivo, which is typically not simulated under standard cell culture conditions. This disparity is especially relevant when studying biochemical processes that govern extracellular matrix (ECM) deposition, which may be altered due to dilution of secreted macromolecules by the relatively large volumes of culture medium required for cell maintenance in vitro. Macromolecular crowding (MMC) utilises the addition of inert macromolecules to cell culture medium to mimic such high concentration environments found in vivo. The present study induced MMC using the sucrose polymer Ficoll and examined whether fibrillin-1 deposition by human lung fibroblasts could be augmented. Fibrillin-1 forms extracellular microfibrils, which are versatile scaffolds required for elastic fibre formation, deposition of other ECM proteins and growth factor regulation. Pathogenic variants in the fibrillin-1 gene (FBN1) cause Marfan syndrome, where ECM deposition of fibrillin-1 can be compromised. Using immunocytochemistry, significantly enhanced fibrillin-1 deposition was observed when lung fibroblasts were cultured under MMC conditions. MMC also augmented fibrillin-1 deposition in Marfan syndrome patient-derived skin fibroblasts in a cell line- and likely FBN1 variant-specific manner. The ability of MMC to increase fibrillin-1 deposition suggested potential applications for tissue-engineering approaches, e.g. to generate tendon or vascular tissues, where fibrillin-1 microfibrils and elastic fibres are key determinants of their biomechanical properties. Moreover, it suggested the potency of MMC to better mimic in vivo ECM environments in cell culture studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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