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Enregistrement W4283373432 · doi:10.1093/pnasnexus/pgac095

Sporadic, late-onset, and multistage diseases

2022· article· en· W4283373432 sur OpenAlexfundno aff
A Webster, Robert Clarke

Notice bibliographique

RevuePNAS Nexus · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity of OxfordMedical Research Council CanadaBritish Heart Foundation
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multistage disease processes are often characterized by a linear relationship between the log of incidence rates and the log of age. Examples include sequences of somatic mutations, that can cause cancer, and have recently been linked with a range of non-malignant diseases. Using a Weibull distribution to model diseases that occur through an ordered sequence of stages, and another model where stages can occur in any order, we characterized the age-related onset of disease in UK Biobank data. Despite their different underlying assumptions, both models accurately described the incidence of over 450 diseases, demonstrating that multistage disease processes cannot be inferred from this data alone. The parametric models provided unique insights into age-related disease, that conventional studies of relative risks cannot. The rate at which disease risk increases with age was used to distinguish between "sporadic" diseases, with an initially low and slowly increasing risk, and "late-onset" diseases whose negligible risk when young rapidly increases with age. "Relative aging rates" were introduced to quantify how risk factors modify age-related risk, finding the effective age-at-risk of sporadic diseases is strongly modified by common risk factors. Relative aging rates are ideal for risk-stratification, allowing the identification of ages with equivalent-risk in groups with different exposures. Most importantly, our results suggest that a substantial burden of sporadic diseases can be substantially delayed or avoided by early lifestyle interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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