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Enregistrement W4283451483 · doi:10.1101/2022.06.23.497395

A latitudinal pattern of plant leaf-associated bacterial community assembly

2022· preprint· en· W4283451483 sur OpenAlexafffund
Zihui Wang, Yuan Jiang, Minhua Zhang, Chengjin Chu, Yongfa Chen, Shuai Fang, Guangze Jin, Mingxi Jiang, Juyu Lian, Yanpeng Li, Yu Liu, Keping Ma, Xiangcheng Mi, Xiujuan Qiao, Xihua Wang, Xugao Wang, Han Xu, Wanhui Ye, Li Zhu, Yan Zhu, Fangliang He, Steven W. Kembel

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsHelsingin Yliopisto
Mots-clésTemperate climateBiologySymbiosisEcologyAbundance (ecology)BiodiversityHost (biology)EcosystemLatitudeTropicsPlant communityHabitatBotanySpecies richnessBacteriaGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant-associated microbes are essential for promoting plant well-being, maintaining biodiversity, and supporting ecosystem function. However, little is known about the geographic distribution of plant-microbe symbioses and how they are formed and change along latitudinal gradients. Here we identified leaf bacteria for 328 plant species sampled from 10 forests along a tropical to temperate gradient in China. We analyzed the diversity and composition of plant leaf-associated bacteria and quantified the contributions of hosts, habitats, and neighborhood plants to the plant-bacterial symbiosis. We found a strong latitudinal gradient in leaf bacterial diversity and composition. Bacterial assemblages on leaves were most strongly selected by host plants, and the selection pressure increased with latitude. In contrast, at low latitudes and at large geographical scales multiple factors were found to jointly regulate bacterial community composition. Our result also showed that plant-bacteria symbiotic networks were structured by network hub bacteria taxa with high co-occurrence network centrality, and the abundance of temperate hub taxa was more influenced by host plants than that in tropical forests. For the first time, we documented a previously unrecognized latitudinal gradient in plant-bacterial symbioses that was regulated by a joint effect of multiple factors at low latitudes but mostly by host selection at high latitudes, implying that leaf microbiomes are likely to respond differently to global change along the latitudinal gradient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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