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Enregistrement W4283574665 · doi:10.1101/2022.06.22.497213

COP9 signalosome component CSN-5 stabilizes PUF proteins FBF-1 and FBF-2 in <i>Caenorhabditis elegans</i> germline stem cells

2022· preprint· en· W4283574665 sur OpenAlexfundno aff
Emily Osterli, Mary Ellenbecker, Xiaobo Wang, Mikaya Terzo, Ketch Jacobson, DeAnna Cuello, Ekaterina Voronina

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaOklahoma Medical Research FoundationNational Institutes of HealthUniversity of Montana
Mots-clésCOP9 signalosomeGermlineBiologyCaenorhabditis elegansGerm cellCell biologyNEDD8GeneticsRNA interferenceUbiquitinRNAUbiquitin ligaseGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract RNA-binding proteins FBF-1 and FBF-2 (FBFs) are required for germline stem cell maintenance and the sperm/oocyte switch in Caenorhabditis elegans , though the mechanisms controlling FBF protein levels remain unknown. We identified an interaction between both FBFs and CSN-5, a component of the COP9 (constitutive photomorphogenesis 9) signalosome. Here, we find that the MPN (Mpr1/Pad1 N terminal) metalloprotease domain of CSN-5 interacts with the PUF (Pumilio and FBF) RNA-binding domain of FBFs and the interaction is conserved for human homologs PUM1 and CSN5. The interaction between FBF-2 and CSN-5 can be detected in vivo by proximity ligation. csn-5 mutation results in destabilization of FBF proteins, a decrease in the numbers of germline stem cells, and disruption of the switch from spermatogenesis to oogenesis. The loss of csn-5 does not decrease the levels of a related PUF protein PUF-3 and csn-5(lf ) phenotype is not enhanced by fbf-1/2 depletion, suggesting that the effect is specific to FBFs. The effect of csn-5 on germline sex determination is largely independent of the COP9 signalosome and is cell autonomous. Surprisingly, regulation of FBF protein levels involves a combination of COP9-dependent and –independent mechanisms differentially affecting FBF-1 and FBF-2. This work supports a previously unappreciated role for CSN-5 in stabilization of germline stem cell regulatory proteins FBF-1 and FBF-2. Author Summary Germ cell development and reproductive success in the nematode C. elegans rely on the function of germline stem cells. Continued maintenance of these cells is supported by the activity of conserved RNA-binding proteins FBF-1 and FBF-2 (FBFs). However, it is unknown how FBF protein levels are regulated. Here, we identify a direct interaction between FBFs and CSN-5, a component of the COP9 signalosome best known for its role in regulating protein degradation. We find that CSN-5 promotes FBF stability and allows for accumulation of steady-state protein levels, thereby promoting FBF function. In csn-5 mutants, we find a significant reduction of FBF proteins, decrease of stem cells, and failure to promote oogenesis consistent with compromised FBF function. Furthermore, CSN-5 contributes to FBF protein stability through two mechanisms. This work demonstrates a previously unappreciated role for CSN-5 in stabilization of FBF proteins. Based on our finding that the FBF/CSN-5 interaction is conserved and detectable between homologous human proteins, we speculate this relationship might be relevant for understanding stem cell maintenance in a range of species, from nematodes to humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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