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Enregistrement W4283576277 · doi:10.1080/14756366.2022.2092729

Structure-activity relationship studies for inhibitors for vancomycin-resistant <i>Enterococcus</i> and human carbonic anhydrases

2022· article· en· W4283576277 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme function and inhibition
Établissements canadiensPurdue Pharma (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca
Mots-clésCarbonic anhydraseAcetazolamideEnzymeEnterococcus faeciumEnterococcus faecalisDruggabilityMicrobiologyChemistryHomology modelingEnterococcusCarbonic anhydrase IIVancomycin-Resistant EnterococciMechanism of actionActive siteVancomycinBiochemistryBacteriaAntibioticsBiologyStaphylococcus aureusEscherichia coliIn vitroGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vancomycin-resistant enterococci (VRE), consisting of pathogenic Enterococcus faecalis and E. faecium, is a leading cause of hospital-acquired infections (HAIs). We recently repurposed the FDA-approved human carbonic anhydrase (CA) inhibitor acetazolamide (AZM) against VRE agent with the likely mechanism of action for the molecules being inhibition of one, or both, of the bacterial CA isoforms expressed in VRE. To elucidate how inhibitor binding to the enzymes relates to MIC, we further characterised the inhibition constants (Ki) against the E. faecium α-CA (Efα-CA) and γ-CA (Efγ-CA), as well as against human CA I (hCAI) and human CA II (hCAII) to assess selectivity. We have also utilised homology modelling and molecular dynamics (MD) simulations to gain a better understanding of the potential interactions the molecules are making with the targets. In this paper, we elaborate on the SAR for the AZM analogs as it pertains to MIC and Ki for each CA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle