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Enregistrement W4283650051 · doi:10.1089/neu.2022.0175

International Spinal Cord Injury Biobank: A Biorepository and Resource for Translational Research

2022· article· en· W4283650051 sur OpenAlexaffabout
Veronica Hirsch‐Reinshagen, Adam Velenosi, Sarah Morris, Kevin Dong, Zahra Samadi‐Bahrami, Sureyah Nassimbwa, Eslam Abdelaziz, Piotr Kozłowski, G. R. Wayne Moore, Cornelia Laule, Brian K. Kwon

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurotrauma · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpinal Cord Injury Research
Établissements canadiensPraxis Spinal Cord InstituteInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiobankTranslational researchBiorepositorySpinal cord injuryCertificationMedicineEngineering ethicsPsychologyEngineeringBioinformaticsPolitical scienceNeurosciencePathologySpinal cord

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the past few decades, tremendous advances have been made in our understanding of the biological changes underpinning the devastating impairment of traumatic spinal cord injury (SCI). Much of this scientific research has focused on animal models of SCI, and comparatively little has been done in human SCI, largely because biospecimens from human SCI patients are not readily available. This paucity of scientific enquiry in human SCI represents an important void in the spectrum of translational research, as biological differences between animal models and the human condition need to be considered in the pre-clinical development of therapeutic approaches. The International Spinal Cord Injury Biobank (ISCIB) is a multi-user biorepository with the mission of accelerating therapeutic development in traumatic SCI through improved biological understanding of human injury, and the vision of serving as a global research resource where human SCI biospecimens are shared with researchers around the world. Aligned with internationally recognized best practices, ISCIB's formal governance structure and standard operating procedures have earned it official biobank certification through the Canadian Tissue Repository Network. Herein, we describe the translational research gap that ISCIB is helping to fill; its structure, governance and certification; how data and samples are accrued, processed and stored; and finally, the process through which samples and data are shared with global researchers. The purpose of this paper describing ISCIB is to serve as an introductory guidance document for the wider community of SCI researchers. By helping researchers understand the contents of ISCIB and the process of accessing biospecimens, we seek to further ISCIB's vision as being a resource for human and translational research in SCI, with the ultimate goal of finding disease-modifying therapies for this disabling condition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,166
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,132
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,166
Score d'incertitude au seuil0,879

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1660,132
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0180,022
Études des sciences et des technologies0,0110,005
Communication savante0,0200,011
Science ouverte0,0080,022
Intégrité de la recherche0,0040,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0570,050

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,239
Tête enseignante GPT0,493
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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