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Enregistrement W4283656124 · doi:10.1111/his.14706

Clear cell stromal tumour of the lung with <i>YAP1::TFE3</i> fusion: four cases including a case with highly aggressive clinical course

2022· article· en· W4283656124 sur OpenAlexaff
Carina Dehner, David Sadegh, Fouad Boulos, Nidia Messias, Wei‐Lien Wang, Elizabeth G. Demicco, John S.A. Chrisinger

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberous Sclerosis Complex Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNuclear atypiaTFE3PathologyImmunohistochemistryMedicineAtypiaBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aims Clear cell stromal tumour of the lung (CCST‐L) is a rare, recently recognised neoplasm which has been found to express TFE3 and harbour YAP1::TFE3 fusions. Initial data suggested a benign process; however, a single reported case gave rise to distant metastases. We sought to describe the clinicopathological and molecular features of additional cases of CCST‐L. Methods and Results Pathology and molecular archives were searched for cases of CCST‐L or tumours with YAP1::TFE3 fusions. Clinical features were noted. Available slides, including immunohistochemical studies, were re‐reviewed for diagnosis confirmation and assessment of pathological features. Results of molecular studies were also recorded. Four tumours were identified, all occurring in women (median age = 61 years, range = 24–69). Median tumour size was 4.4 cm (range = 1–9.5 cm); three tumours were unifocal and one was multifocal. Tumours were composed of epithelioid to spindled cells with eosinophilic to clear cytoplasm and grew in sheets, vague nests and short fascicles. Nuclear atypia was predominately mild; however, two cases showed scattered atypical cells. Mitotic activity was generally low, although one case showed a mitotic count of 6/2 mm2. All tumours expressed TFE3 and harboured YAP1::TFE3 fusions. One case was unresectable and was treated with chemotherapy, and two underwent complete resection. One patient died of disease 7 months following diagnosis, while a second patient was alive with no evidence of disease after 43 months. Follow‐up was not available for two cases. Conclusion CCST‐L expresses TFE3, harbours YAP1::TFE3 fusions and at least rare cases behave in an aggressive manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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