The Human Genome Project as a Singular Episode in the History of Genomics
Notice bibliographique
Résumé
In this paper, we progressively de-center the Human Genome Project (HGP) in the history of genomics and human genomics. We show that the HGP, understood as an international effort to make the human reference genome sequence publicly available, constitutes a specific model of genomics: prominent and influential but nevertheless distinct from others that preceded, existed alongside, and succeeded it. Our analysis of a comprehensive corpus of publications describing human DNA sequences submitted to public databases from 1985 to 2005 reveals a plethora of authoring institutions, with only a few contributing to the HGP. Examining these publications in a co-authorship network enables us to propose two different sequencing approaches—horizontal and vertical sequencing—whose changing dynamics shaped the history of human genomics. We argue that investigating the extent to which different institutions combined these approaches or prioritized one of them captures the history of genomics better than using the categories of large-scale sequence production and sequence use, as much scholarly literature concerning the HGP has done. Sequence production and use became fully distinct only within the HGP model, and especially during the last stages of this endeavor. By exploring a collaboration between Celera Genomics, a large-scale sequencing institution, and two medical genetics laboratories, we show the potential of our co-authorship network and its analysis for historical research. Our study connects the historiographies of medical genetics and human genomics and indicates that the so-called translational gap from sequence data to clinical outcomes may reflect the assumption that genomics was substantially different from prior and parallel genetics research. This essay is part of a special issue entitled The Sequences and the Sequencers: A New Approach to Investigating the Emergence of Yeast, Human, and Pig Genomics, edited by Miguel García-Sancho and James Lowe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».